RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428678.1

UPK3BP1-201, Transcript of uroplakin 3B pseudogene 1, humanhuman

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Gene UPK3BP1, Length 509 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BP1-201ENST00000428678 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.35■■□□□ 1.81
UPK3BP1-201ENST00000428678 PLSCR1O15162 318 aa26.34■■□□□ 1.81
UPK3BP1-201ENST00000428678 YY1P25490 414 aa26.34■■□□□ 1.81
UPK3BP1-201ENST00000428678 SOX12O15370 315 aa26.33■■□□□ 1.81
UPK3BP1-201ENST00000428678 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.33■■□□□ 1.81
UPK3BP1-201ENST00000428678 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
UPK3BP1-201ENST00000428678 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.32■■□□□ 1.8
UPK3BP1-201ENST00000428678 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.32■■□□□ 1.8
UPK3BP1-201ENST00000428678 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
UPK3BP1-201ENST00000428678 AKAP12Q02952 1782 aa26.32■■□□□ 1.8
UPK3BP1-201ENST00000428678 RGPD5Q99666 1765 aa26.31■■□□□ 1.8
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UPK3BP1-201ENST00000428678 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
UPK3BP1-201ENST00000428678 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
UPK3BP1-201ENST00000428678 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa26.31■■□□□ 1.8
UPK3BP1-201ENST00000428678 NINLQ9Y2I6 1382 aa26.31■■□□□ 1.8
UPK3BP1-201ENST00000428678 DCAF8L1A6NGE4 600 aa26.3■■□□□ 1.8
UPK3BP1-201ENST00000428678 ARHGEF25Q86VW2 580 aa26.3■■□□□ 1.8
UPK3BP1-201ENST00000428678 KCNH5Q8NCM2 988 aa26.3■■□□□ 1.8
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
UPK3BP1-201ENST00000428678 CARD10Q9BWT7 1032 aa26.27■■□□□ 1.8
UPK3BP1-201ENST00000428678 CASZ1Q86V15 1759 aa26.25■■□□□ 1.79
UPK3BP1-201ENST00000428678 BCL9O00512 1426 aa26.25■■□□□ 1.79
UPK3BP1-201ENST00000428678 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
UPK3BP1-201ENST00000428678 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.25■■□□□ 1.79
UPK3BP1-201ENST00000428678 PROM2Q8N271 834 aa26.24■■□□□ 1.79
UPK3BP1-201ENST00000428678 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
UPK3BP1-201ENST00000428678 NFAT5O94916 1531 aa26.23■■□□□ 1.79
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UPK3BP1-201ENST00000428678 EXOC5O00471 708 aa26.22■■□□□ 1.79
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZBTB7AO95365 584 aa26.22■■□□□ 1.79
UPK3BP1-201ENST00000428678 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.21■■□□□ 1.79
UPK3BP1-201ENST00000428678 STK32BQ9NY57 414 aa26.2■■□□□ 1.78
UPK3BP1-201ENST00000428678 CCDC7Q96M83 1385 aa26.2■■□□□ 1.78
UPK3BP1-201ENST00000428678 TXNRD1Q16881 649 aa26.19■■□□□ 1.78
UPK3BP1-201ENST00000428678 NEUROD1Q13562 356 aa26.18■■□□□ 1.78
UPK3BP1-201ENST00000428678 TNS2Q63HR2 1409 aa26.17■■□□□ 1.78
UPK3BP1-201ENST00000428678 ABCC6O95255 1503 aa26.17■■□□□ 1.78
UPK3BP1-201ENST00000428678 MYOM1P52179 1685 aa26.16■■□□□ 1.78
UPK3BP1-201ENST00000428678 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.16■■□□□ 1.78
UPK3BP1-201ENST00000428678 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
UPK3BP1-201ENST00000428678 MON2Q7Z3U7 1717 aa26.16■■□□□ 1.78
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLC15A2Q16348 729 aa26.14■■□□□ 1.78
UPK3BP1-201ENST00000428678 PTGER2P43116 358 aa26.13■■□□□ 1.77
UPK3BP1-201ENST00000428678 ACSBG1Q96GR2 724 aa26.12■■□□□ 1.77
UPK3BP1-201ENST00000428678 NLRP2Q9NX02 1062 aa26.12■■□□□ 1.77
UPK3BP1-201ENST00000428678 NHSQ6T4R5 1651 aa26.12■■□□□ 1.77
UPK3BP1-201ENST00000428678 KAT6BQ8WYB5 2073 aa26.11■■□□□ 1.77
UPK3BP1-201ENST00000428678 UTRNP46939 3433 aa26.11■■□□□ 1.77
UPK3BP1-201ENST00000428678 NME9Q86XW9 330 aa26.1■■□□□ 1.77
UPK3BP1-201ENST00000428678 ERBB3P21860 1342 aa26.1■■□□□ 1.77
UPK3BP1-201ENST00000428678 LTN1O94822 1766 aa26.1■■□□□ 1.77
UPK3BP1-201ENST00000428678 USP31Q70CQ4 1352 aa26.09■■□□□ 1.77
UPK3BP1-201ENST00000428678 TMC1Q8TDI8 760 aa26.08■■□□□ 1.77
UPK3BP1-201ENST00000428678 USP54Q70EL1 1684 aa26.08■■□□□ 1.77
UPK3BP1-201ENST00000428678 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa26.07■■□□□ 1.76
UPK3BP1-201ENST00000428678 MTFR1LQ9H019 292 aa26.07■■□□□ 1.76
UPK3BP1-201ENST00000428678 IL2RBP14784 551 aa26.06■■□□□ 1.76
UPK3BP1-201ENST00000428678 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
UPK3BP1-201ENST00000428678 CD163L1Q9NR16 1453 aa26.05■■□□□ 1.76
UPK3BP1-201ENST00000428678 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
UPK3BP1-201ENST00000428678 ANKRD24Q8TF21 1146 aa26.05■■□□□ 1.76
UPK3BP1-201ENST00000428678 BTAF1O14981 1849 aa26.04■■□□□ 1.76
UPK3BP1-201ENST00000428678 SYT17Q9BSW7 474 aa26.03■■□□□ 1.76
UPK3BP1-201ENST00000428678 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.03■■□□□ 1.76
UPK3BP1-201ENST00000428678 PAPPAQ13219 1627 aa26.01■■□□□ 1.75
UPK3BP1-201ENST00000428678 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa26.01■■□□□ 1.75
UPK3BP1-201ENST00000428678 SGIP1Q9BQI5 828 aa26■■□□□ 1.75
UPK3BP1-201ENST00000428678 ARXQ96QS3 562 aa25.98■■□□□ 1.75
UPK3BP1-201ENST00000428678 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.98■■□□□ 1.75
UPK3BP1-201ENST00000428678 A0A1W2PP64 1363 aa25.96■■□□□ 1.75
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF827Q17R98 1081 aa25.96■■□□□ 1.75
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
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UPK3BP1-201ENST00000428678 CHD4Q14839 1912 aa25.94■■□□□ 1.74
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UPK3BP1-201ENST00000428678 AKT1S1Q96B36 256 aa25.88■■□□□ 1.73
UPK3BP1-201ENST00000428678 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
UPK3BP1-201ENST00000428678 TONSLQ96HA7 1378 aa25.87■■□□□ 1.73
UPK3BP1-201ENST00000428678 KLHL34Q8N239 644 aa25.87■■□□□ 1.73
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UPK3BP1-201ENST00000428678 SLC16A10Q8TF71 515 aa25.85■■□□□ 1.73
UPK3BP1-201ENST00000428678 COG3Q96JB2 828 aa25.85■■□□□ 1.73
UPK3BP1-201ENST00000428678 MAP3K19Q56UN5 1328 aa25.85■■□□□ 1.73
UPK3BP1-201ENST00000428678 POLD1P28340 1107 aa25.84■■□□□ 1.73
UPK3BP1-201ENST00000428678 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
UPK3BP1-201ENST00000428678 KCNQ4P56696 695 aa25.84■■□□□ 1.73
UPK3BP1-201ENST00000428678 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.84■■□□□ 1.73
UPK3BP1-201ENST00000428678 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.84■■□□□ 1.73
UPK3BP1-201ENST00000428678 HOXC9P31274 260 aa25.83■■□□□ 1.73
UPK3BP1-201ENST00000428678 AMPHP49418 695 aa25.83■■□□□ 1.73
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