RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 FLT4P35916 1363 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXA4-202ENST00000428284 KIF24Q5T7B8 1368 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXA4-202ENST00000428284 CHRNA2Q15822 529 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXA4-202ENST00000428284 ABCC6O95255 1503 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXA4-202ENST00000428284 PLCH1Q4KWH8 1693 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXA4-202ENST00000428284 LMO7Q8WWI1 1683 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXA4-202ENST00000428284 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
HOXA4-202ENST00000428284 HOXC9P31274 260 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXA4-202ENST00000428284 CFAP53Q96M91 514 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXA4-202ENST00000428284 IP6K1Q92551 441 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXA4-202ENST00000428284 FAM83GA6ND36 823 aa27.7■■■□□ 2.03
HOXA4-202ENST00000428284 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa27.7■■■□□ 2.03
HOXA4-202ENST00000428284 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
HOXA4-202ENST00000428284 ILDR2Q71H61 639 aa27.69■■■□□ 2.02
HOXA4-202ENST00000428284 INSRP06213 1382 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXA4-202ENST00000428284 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
HOXA4-202ENST00000428284 NWD2Q9ULI1 1742 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXA4-202ENST00000428284 MRS2Q9HD23 443 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXA4-202ENST00000428284 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC184Q52MB2 194 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXA4-202ENST00000428284 AXIN2Q9Y2T1 843 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXA4-202ENST00000428284 CCER2I3L3R5 266 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXA4-202ENST00000428284 C8orf37Q96NL8 207 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXA4-202ENST00000428284 RGPD2P0DJD1 1756 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXA4-202ENST00000428284 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
HOXA4-202ENST00000428284 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
HOXA4-202ENST00000428284 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
HOXA4-202ENST00000428284 NRAPQ86VF7 1730 aa27.64■■■□□ 2.01
HOXA4-202ENST00000428284 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
HOXA4-202ENST00000428284 BTG4Q9NY30 223 aa27.63■■■□□ 2.01
HOXA4-202ENST00000428284 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
HOXA4-202ENST00000428284 NGLY1Q96IV0 654 aa27.62■■■□□ 2.01
HOXA4-202ENST00000428284 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
HOXA4-202ENST00000428284 ANKRD24Q8TF21 1146 aa27.61■■■□□ 2.01
HOXA4-202ENST00000428284 ERBB3P21860 1342 aa27.61■■■□□ 2.01
HOXA4-202ENST00000428284 SLIT2O94813 1529 aa27.6■■■□□ 2.01
HOXA4-202ENST00000428284 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa27.59■■■□□ 2.01
HOXA4-202ENST00000428284 STRN4Q9NRL3 753 aa27.59■■■□□ 2.01
HOXA4-202ENST00000428284 RGPD1P0DJD0 1748 aa27.58■■■□□ 2.01
HOXA4-202ENST00000428284 EVA1CP58658 441 aa27.58■■■□□ 2.01
HOXA4-202ENST00000428284 IL13P35225 146 aa27.57■■■□□ 2
HOXA4-202ENST00000428284 NUDCQ9Y266 331 aa27.57■■■□□ 2
HOXA4-202ENST00000428284 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
HOXA4-202ENST00000428284 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
HOXA4-202ENST00000428284 WDR17Q8IZU2 1322 aa27.54■■■□□ 2
HOXA4-202ENST00000428284 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP27.54■■■□□ 2
HOXA4-202ENST00000428284 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
HOXA4-202ENST00000428284 AFF2P51816 1311 aa27.53■■■□□ 2
HOXA4-202ENST00000428284 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa27.52■■■□□ 2
HOXA4-202ENST00000428284 NLRP2Q9NX02 1062 aa27.52■■■□□ 2
HOXA4-202ENST00000428284 BCL9LQ86UU0 1499 aa27.51■■■□□ 2
HOXA4-202ENST00000428284 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
HOXA4-202ENST00000428284 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP27.51■■□□□ 1.99
HOXA4-202ENST00000428284 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
HOXA4-202ENST00000428284 POTEAQ6S8J7 498 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXA4-202ENST00000428284 UNC5CLQ8IV45 518 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXA4-202ENST00000428284 EYA1Q99502 592 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXA4-202ENST00000428284 USP21Q9UK80 565 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXA4-202ENST00000428284 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
HOXA4-202ENST00000428284 CRB1P82279 1406 aa27.49■■□□□ 1.99
HOXA4-202ENST00000428284 NBPF6Q5VWK0 638 aa27.49■■□□□ 1.99
HOXA4-202ENST00000428284 NBPF4Q96M43 638 aa27.49■■□□□ 1.99
HOXA4-202ENST00000428284 IGSF1Q8N6C5 1336 aa27.48■■□□□ 1.99
HOXA4-202ENST00000428284 FAM9BQ8IZU0 186 aa27.48■■□□□ 1.99
HOXA4-202ENST00000428284 USHBP1Q8N6Y0 703 aa27.48■■□□□ 1.99
HOXA4-202ENST00000428284 HMOX1P09601 288 aa27.46■■□□□ 1.99
HOXA4-202ENST00000428284 SULT6B1Q6IMI4 303 aa27.46■■□□□ 1.99
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.99
HOXA4-202ENST00000428284 WNK3Q9BYP7 1800 aa27.45■■□□□ 1.98
HOXA4-202ENST00000428284 USP35Q9P2H5 1018 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXA4-202ENST00000428284 NCAPD2Q15021 1401 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXA4-202ENST00000428284 AEBP1Q8IUX7 1158 aa27.43■■□□□ 1.98
HOXA4-202ENST00000428284 CARD10Q9BWT7 1032 aa27.43■■□□□ 1.98
HOXA4-202ENST00000428284 ADAMTS8Q9UP79 889 aa27.43■■□□□ 1.98
HOXA4-202ENST00000428284 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
HOXA4-202ENST00000428284 KDRP35968 1356 aa27.41■■□□□ 1.98
HOXA4-202ENST00000428284 VPS72Q15906 364 aa27.41■■□□□ 1.98
HOXA4-202ENST00000428284 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
HOXA4-202ENST00000428284 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa27.4■■□□□ 1.98
HOXA4-202ENST00000428284 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa27.4■■□□□ 1.98
HOXA4-202ENST00000428284 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa27.39■■□□□ 1.98
HOXA4-202ENST00000428284 ATRNO75882 1429 aa27.39■■□□□ 1.97
HOXA4-202ENST00000428284 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
HOXA4-202ENST00000428284 FCHSD2O94868 740 aa27.38■■□□□ 1.97
HOXA4-202ENST00000428284 RXRBP28702 533 aa27.38■■□□□ 1.97
HOXA4-202ENST00000428284 RSPH6AQ9H0K4 717 aa27.38■■□□□ 1.97
HOXA4-202ENST00000428284 PRKAR2BP31323 418 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXA4-202ENST00000428284 TCP11L2Q8N4U5 519 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXA4-202ENST00000428284 SOCS7O14512 581 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC146Q8IYE0 955 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXA4-202ENST00000428284 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXA4-202ENST00000428284 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
HOXA4-202ENST00000428284 MEGF6O75095 1541 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXA4-202ENST00000428284 GLI3P10071 1580 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXA4-202ENST00000428284 NEFMP07197 916 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXA4-202ENST00000428284 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
HOXA4-202ENST00000428284 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
HOXA4-202ENST00000428284 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXA4-202ENST00000428284 IL2RBP14784 551 aa27.31■■□□□ 1.96
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