RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417593.1

RPL17P11-201, Transcript of ribosomal protein L17 pseudogene 11, humanhuman

BASIC

Gene RPL17P11, Length 544 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P11-201ENST00000417593 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
RPL17P11-201ENST00000417593 AATKQ6ZMQ8 1374 aa20.34■□□□□ 0.85
RPL17P11-201ENST00000417593 AKAP12Q02952 1782 aa20.34■□□□□ 0.85
RPL17P11-201ENST00000417593 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
RPL17P11-201ENST00000417593 COL18A1P39060 1754 aa20.32■□□□□ 0.84
RPL17P11-201ENST00000417593 C1QTNF8P60827 252 aa20.32■□□□□ 0.84
RPL17P11-201ENST00000417593 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
RPL17P11-201ENST00000417593 SLIT3O75094 1523 aa20.32■□□□□ 0.84
RPL17P11-201ENST00000417593 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
RPL17P11-201ENST00000417593 TXNRD1Q16881 649 aa20.31■□□□□ 0.84
RPL17P11-201ENST00000417593 SGIP1Q9BQI5 828 aa20.31■□□□□ 0.84
RPL17P11-201ENST00000417593 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa20.3■□□□□ 0.84
RPL17P11-201ENST00000417593 SLC15A2Q16348 729 aa20.3■□□□□ 0.84
RPL17P11-201ENST00000417593 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa20.3■□□□□ 0.84
RPL17P11-201ENST00000417593 STK32BQ9NY57 414 aa20.3■□□□□ 0.84
RPL17P11-201ENST00000417593 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
RPL17P11-201ENST00000417593 CEP350Q5VT06 3117 aa20.3■□□□□ 0.84
RPL17P11-201ENST00000417593 ZBTB7CA1YPR0 619 aa20.29■□□□□ 0.84
RPL17P11-201ENST00000417593 MTFR1LQ9H019 292 aa20.29■□□□□ 0.84
RPL17P11-201ENST00000417593 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.28■□□□□ 0.84
RPL17P11-201ENST00000417593 WDR17Q8IZU2 1322 aa20.27■□□□□ 0.84
RPL17P11-201ENST00000417593 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
RPL17P11-201ENST00000417593 NLRP6P59044 892 aa20.26■□□□□ 0.83
RPL17P11-201ENST00000417593 AXIN2Q9Y2T1 843 aa20.26■□□□□ 0.83
RPL17P11-201ENST00000417593 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa20.26■□□□□ 0.83
RPL17P11-201ENST00000417593 USP6P35125 1406 aa20.26■□□□□ 0.83
RPL17P11-201ENST00000417593 PIK3C2AO00443 1686 aa20.25■□□□□ 0.83
RPL17P11-201ENST00000417593 MAP3K5Q99683 1374 aa20.24■□□□□ 0.83
RPL17P11-201ENST00000417593 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
RPL17P11-201ENST00000417593 IFFO2Q5TF58 517 aa20.24■□□□□ 0.83
RPL17P11-201ENST00000417593 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
RPL17P11-201ENST00000417593 RGPD5Q99666 1765 aa20.23■□□□□ 0.83
RPL17P11-201ENST00000417593 PAPPAQ13219 1627 aa20.23■□□□□ 0.83
RPL17P11-201ENST00000417593 ARXQ96QS3 562 aa20.22■□□□□ 0.83
RPL17P11-201ENST00000417593 CABP2Q9NPB3 220 aa20.22■□□□□ 0.83
RPL17P11-201ENST00000417593 NHSQ6T4R5 1651 aa20.21■□□□□ 0.83
RPL17P11-201ENST00000417593 CARD10Q9BWT7 1032 aa20.2■□□□□ 0.82
RPL17P11-201ENST00000417593 ARHGEF25Q86VW2 580 aa20.19■□□□□ 0.82
RPL17P11-201ENST00000417593 CABP1Q9NZU7 370 aa20.19■□□□□ 0.82
RPL17P11-201ENST00000417593 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa20.19■□□□□ 0.82
RPL17P11-201ENST00000417593 QRICH2Q9H0J4 1663 aa20.19■□□□□ 0.82
RPL17P11-201ENST00000417593 TNS2Q63HR2 1409 aa20.19■□□□□ 0.82
RPL17P11-201ENST00000417593 EXOC5O00471 708 aa20.18■□□□□ 0.82
RPL17P11-201ENST00000417593 NBPF1Q3BBV0 1214 aa20.18■□□□□ 0.82
RPL17P11-201ENST00000417593 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
RPL17P11-201ENST00000417593 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
RPL17P11-201ENST00000417593 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa20.15■□□□□ 0.82
RPL17P11-201ENST00000417593 CCDC7Q96M83 1385 aa20.15■□□□□ 0.82
RPL17P11-201ENST00000417593 ABCC6O95255 1503 aa20.14■□□□□ 0.81
RPL17P11-201ENST00000417593 GPR162Q16538 588 aa20.14■□□□□ 0.81
RPL17P11-201ENST00000417593 BTAF1O14981 1849 aa20.13■□□□□ 0.81
RPL17P11-201ENST00000417593 ZNF827Q17R98 1081 aa20.13■□□□□ 0.81
RPL17P11-201ENST00000417593 KCNH5Q8NCM2 988 aa20.13■□□□□ 0.81
RPL17P11-201ENST00000417593 NFAT5O94916 1531 aa20.12■□□□□ 0.81
RPL17P11-201ENST00000417593 ACSBG1Q96GR2 724 aa20.12■□□□□ 0.81
RPL17P11-201ENST00000417593 COL24A1Q17RW2 1714 aa20.12■□□□□ 0.81
RPL17P11-201ENST00000417593 SHANK3Q9BYB0 1731 aa20.12■□□□□ 0.81
RPL17P11-201ENST00000417593 QSER1Q2KHR3 1735 aa20.1■□□□□ 0.81
RPL17P11-201ENST00000417593 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa20.1■□□□□ 0.81
RPL17P11-201ENST00000417593 SOX12O15370 315 aa20.1■□□□□ 0.81
RPL17P11-201ENST00000417593 LRRC4BQ9NT99 713 aa20.09■□□□□ 0.81
RPL17P11-201ENST00000417593 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
RPL17P11-201ENST00000417593 SLC16A10Q8TF71 515 aa20.07■□□□□ 0.8
RPL17P11-201ENST00000417593 AKT1S1Q96B36 256 aa20.06■□□□□ 0.8
RPL17P11-201ENST00000417593 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
RPL17P11-201ENST00000417593 TTC21AQ8NDW8 1320 aa20.05■□□□□ 0.8
RPL17P11-201ENST00000417593 KLHL34Q8N239 644 aa20.05■□□□□ 0.8
RPL17P11-201ENST00000417593 KAT6BQ8WYB5 2073 aa20.05■□□□□ 0.8
RPL17P11-201ENST00000417593 POLD1P28340 1107 aa20.04■□□□□ 0.8
RPL17P11-201ENST00000417593 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
RPL17P11-201ENST00000417593 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa20.04■□□□□ 0.8
RPL17P11-201ENST00000417593 ERBB3P21860 1342 aa20.03■□□□□ 0.8
RPL17P11-201ENST00000417593 EVC2Q86UK5 1308 aa20.03■□□□□ 0.8
RPL17P11-201ENST00000417593 IL2RBP14784 551 aa20.03■□□□□ 0.8
RPL17P11-201ENST00000417593 NLGN2Q8NFZ4 835 aa20.03■□□□□ 0.8
RPL17P11-201ENST00000417593 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa20.02■□□□□ 0.8
RPL17P11-201ENST00000417593 NLRP2Q9NX02 1062 aa20.01■□□□□ 0.79
RPL17P11-201ENST00000417593 SLC27A3Q5K4L6 730 aa20■□□□□ 0.79
RPL17P11-201ENST00000417593 LTN1O94822 1766 aa20■□□□□ 0.79
RPL17P11-201ENST00000417593 USP54Q70EL1 1684 aa20■□□□□ 0.79
RPL17P11-201ENST00000417593 MON2Q7Z3U7 1717 aa19.99■□□□□ 0.79
RPL17P11-201ENST00000417593 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP19.98■□□□□ 0.79
RPL17P11-201ENST00000417593 USP31Q70CQ4 1352 aa19.97■□□□□ 0.79
RPL17P11-201ENST00000417593 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
RPL17P11-201ENST00000417593 GRIN3BO60391 1043 aa19.96■□□□□ 0.79
RPL17P11-201ENST00000417593 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa19.96■□□□□ 0.79
RPL17P11-201ENST00000417593 LY75O60449 1722 aa19.95■□□□□ 0.78
RPL17P11-201ENST00000417593 ATP10DQ9P241 1426 aa19.94■□□□□ 0.78
RPL17P11-201ENST00000417593 KCNQ4P56696 695 aa19.94■□□□□ 0.78
RPL17P11-201ENST00000417593 ANKRD24Q8TF21 1146 aa19.94■□□□□ 0.78
RPL17P11-201ENST00000417593 DOT1LQ8TEK3 1739 aa19.91■□□□□ 0.78
RPL17P11-201ENST00000417593 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP19.91■□□□□ 0.78
RPL17P11-201ENST00000417593 NME9Q86XW9 330 aa19.9■□□□□ 0.78
RPL17P11-201ENST00000417593 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
RPL17P11-201ENST00000417593 NSD2O96028 1365 aa19.9■□□□□ 0.78
RPL17P11-201ENST00000417593 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa19.9■□□□□ 0.78
RPL17P11-201ENST00000417593 CD163L1Q9NR16 1453 aa19.89■□□□□ 0.77
RPL17P11-201ENST00000417593 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa19.89■□□□□ 0.77
RPL17P11-201ENST00000417593 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
RPL17P11-201ENST00000417593 ADCY9O60503 1353 aa19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms