RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397149.3

SMU1-201, Transcript of SMU1, DNA replication regulator and spliceosomal factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMU1, Length 7,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMU1-201ENST00000397149 TNMDQ9H2S6 317 aa14.53□□□□□ -0.08
SMU1-201ENST00000397149 WASHC2AQ641Q2 1341 aa14.52□□□□□ -0.08
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SMU1-201ENST00000397149 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
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SMU1-201ENST00000397149 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SMU1-201ENST00000397149 HOOK3Q86VS8 718 aa14.52□□□□□ -0.09
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SMU1-201ENST00000397149 MPHOSPH9Q99550 1183 aa14.52□□□□□ -0.09
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SMU1-201ENST00000397149 SH3BP5O60239 455 aa14.43□□□□□ -0.1
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SMU1-201ENST00000397149 MYL6BP14649 208 aa14.43□□□□□ -0.1
SMU1-201ENST00000397149 CFAP100Q494V2 611 aa14.43□□□□□ -0.1
SMU1-201ENST00000397149 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa14.43□□□□□ -0.1
SMU1-201ENST00000397149 TERF1P54274 439 aa14.43□□□□□ -0.1
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SMU1-201ENST00000397149 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
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