RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa30.99■■■□□ 2.55
CNN3-202ENST00000394202 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
CNN3-202ENST00000394202 IP6K1Q92551 441 aa30.98■■■□□ 2.55
CNN3-202ENST00000394202 KIF24Q5T7B8 1368 aa30.98■■■□□ 2.55
CNN3-202ENST00000394202 AXIN2Q9Y2T1 843 aa30.95■■■□□ 2.54
CNN3-202ENST00000394202 PHLPP1O60346 1717 aa30.94■■■□□ 2.54
CNN3-202ENST00000394202 RTL1A6NKG5 1358 aa30.94■■■□□ 2.54
CNN3-202ENST00000394202 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
CNN3-202ENST00000394202 HMOX1P09601 288 aa30.93■■■□□ 2.54
CNN3-202ENST00000394202 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
CNN3-202ENST00000394202 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
CNN3-202ENST00000394202 KIAA0232Q92628 1395 aa30.92■■■□□ 2.54
CNN3-202ENST00000394202 CHRNA2Q15822 529 aa30.91■■■□□ 2.54
CNN3-202ENST00000394202 APAF1O14727 1248 aa30.89■■■□□ 2.54
CNN3-202ENST00000394202 PLEKHF1Q96S99 279 aa30.89■■■□□ 2.54
CNN3-202ENST00000394202 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
CNN3-202ENST00000394202 AEBP1Q8IUX7 1158 aa30.88■■■□□ 2.53
CNN3-202ENST00000394202 RSPH6AQ9H0K4 717 aa30.88■■■□□ 2.53
CNN3-202ENST00000394202 RUNDC1Q96C34 613 aa30.88■■■□□ 2.53
CNN3-202ENST00000394202 ABCA3Q99758 1704 aa30.87■■■□□ 2.53
CNN3-202ENST00000394202 EYA1Q99502 592 aa30.87■■■□□ 2.53
CNN3-202ENST00000394202 CPDO75976 1380 aa30.87■■■□□ 2.53
CNN3-202ENST00000394202 ZBED9Q6R2W3 1325 aa30.86■■■□□ 2.53
CNN3-202ENST00000394202 FCHSD2O94868 740 aa30.86■■■□□ 2.53
CNN3-202ENST00000394202 SULT6B1Q6IMI4 303 aa30.85■■■□□ 2.53
CNN3-202ENST00000394202 RGPD1P0DJD0 1748 aa30.84■■■□□ 2.53
CNN3-202ENST00000394202 PRKAR2BP31323 418 aa30.84■■■□□ 2.53
CNN3-202ENST00000394202 COL18A1P39060 1754 aa30.83■■■□□ 2.53
CNN3-202ENST00000394202 TCP11L2Q8N4U5 519 aa30.83■■■□□ 2.53
CNN3-202ENST00000394202 PRDM11Q9NQV5 511 aa30.83■■■□□ 2.53
CNN3-202ENST00000394202 ANKRD24Q8TF21 1146 aa30.82■■■□□ 2.52
CNN3-202ENST00000394202 IGSF1Q8N6C5 1336 aa30.82■■■□□ 2.52
CNN3-202ENST00000394202 RGPD5Q99666 1765 aa30.81■■■□□ 2.52
CNN3-202ENST00000394202 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
CNN3-202ENST00000394202 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
CNN3-202ENST00000394202 NBPF6Q5VWK0 638 aa30.81■■■□□ 2.52
CNN3-202ENST00000394202 PHACTR3Q96KR7 559 aa30.81■■■□□ 2.52
CNN3-202ENST00000394202 NBPF4Q96M43 638 aa30.81■■■□□ 2.52
CNN3-202ENST00000394202 USHBP1Q8N6Y0 703 aa30.79■■■□□ 2.52
CNN3-202ENST00000394202 FAM83GA6ND36 823 aa30.79■■■□□ 2.52
CNN3-202ENST00000394202 ERBB3P21860 1342 aa30.77■■■□□ 2.52
CNN3-202ENST00000394202 NEUROD2Q15784 382 aa30.77■■■□□ 2.52
CNN3-202ENST00000394202 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
CNN3-202ENST00000394202 KDRP35968 1356 aa30.75■■■□□ 2.51
CNN3-202ENST00000394202 HSPA1LP34931 641 aa30.75■■■□□ 2.51
CNN3-202ENST00000394202 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
CNN3-202ENST00000394202 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa30.74■■■□□ 2.51
CNN3-202ENST00000394202 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa30.74■■■□□ 2.51
CNN3-202ENST00000394202 RGPD2P0DJD1 1756 aa30.74■■■□□ 2.51
CNN3-202ENST00000394202 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP30.72■■■□□ 2.51
CNN3-202ENST00000394202 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP30.72■■■□□ 2.51
CNN3-202ENST00000394202 TMPOP42166 694 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
CNN3-202ENST00000394202 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP30.72■■■□□ 2.51
CNN3-202ENST00000394202 ABCC6O95255 1503 aa30.71■■■□□ 2.51
CNN3-202ENST00000394202 LMO7Q8WWI1 1683 aa30.71■■■□□ 2.51
CNN3-202ENST00000394202 ADAMTS2O95450 1211 aa30.7■■■□□ 2.51
CNN3-202ENST00000394202 ZNF521Q96K83 1311 aa30.69■■■□□ 2.5
CNN3-202ENST00000394202 JCADQ9P266 1359 aa30.69■■■□□ 2.5
CNN3-202ENST00000394202 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa30.67■■■□□ 2.5
CNN3-202ENST00000394202 NLRP2Q9NX02 1062 aa30.67■■■□□ 2.5
CNN3-202ENST00000394202 WWC1Q8IX03 1113 aa30.66■■■□□ 2.5
CNN3-202ENST00000394202 CDCA7LQ96GN5 454 aa30.66■■■□□ 2.5
CNN3-202ENST00000394202 NEFMP07197 916 aa30.66■■■□□ 2.5
CNN3-202ENST00000394202 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
CNN3-202ENST00000394202 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
CNN3-202ENST00000394202 RIPK4P57078 832 aa30.65■■■□□ 2.5
CNN3-202ENST00000394202 BTG4Q9NY30 223 aa30.65■■■□□ 2.5
CNN3-202ENST00000394202 TRIM35Q9UPQ4 493 aa30.65■■■□□ 2.5
CNN3-202ENST00000394202 NCAPD2Q15021 1401 aa30.64■■■□□ 2.5
CNN3-202ENST00000394202 NFE2L2Q16236 605 aa30.64■■■□□ 2.5
CNN3-202ENST00000394202 NGEFQ8N5V2 710 aa30.63■■■□□ 2.49
CNN3-202ENST00000394202 STRN4Q9NRL3 753 aa30.63■■■□□ 2.49
CNN3-202ENST00000394202 WDR17Q8IZU2 1322 aa30.61■■■□□ 2.49
CNN3-202ENST00000394202 CCDC27Q2M243 656 aa30.61■■■□□ 2.49
CNN3-202ENST00000394202 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
CNN3-202ENST00000394202 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
CNN3-202ENST00000394202 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
CNN3-202ENST00000394202 EVA1CP58658 441 aa30.59■■■□□ 2.49
CNN3-202ENST00000394202 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
CNN3-202ENST00000394202 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
CNN3-202ENST00000394202 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa30.57■■■□□ 2.48
CNN3-202ENST00000394202 GOLGA2Q08379 1002 aa30.56■■■□□ 2.48
CNN3-202ENST00000394202 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
CNN3-202ENST00000394202 PDE3BQ13370 1112 aa30.55■■■□□ 2.48
CNN3-202ENST00000394202 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
CNN3-202ENST00000394202 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa30.53■■■□□ 2.48
CNN3-202ENST00000394202 LRP6O75581 1613 aa30.53■■■□□ 2.48
CNN3-202ENST00000394202 DLG5Q8TDM6 1919 aa30.52■■■□□ 2.48
CNN3-202ENST00000394202 DCTN1Q14203 1278 aa30.52■■■□□ 2.48
CNN3-202ENST00000394202 SLFN5Q08AF3 891 aa30.51■■■□□ 2.47
CNN3-202ENST00000394202 CARD10Q9BWT7 1032 aa30.51■■■□□ 2.47
CNN3-202ENST00000394202 WDR63Q8IWG1 891 aa30.5■■■□□ 2.47
CNN3-202ENST00000394202 MEGF6O75095 1541 aa30.5■■■□□ 2.47
CNN3-202ENST00000394202 GAS2L2Q8NHY3 880 aa30.49■■■□□ 2.47
CNN3-202ENST00000394202 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa30.49■■■□□ 2.47
CNN3-202ENST00000394202 USP35Q9P2H5 1018 aa30.49■■■□□ 2.47
CNN3-202ENST00000394202 PLCH1Q4KWH8 1693 aa30.49■■■□□ 2.47
CNN3-202ENST00000394202 C8orf37Q96NL8 207 aa30.48■■■□□ 2.47
CNN3-202ENST00000394202 DUSP27Q5VZP5 1158 aa30.47■■■□□ 2.47
CNN3-202ENST00000394202 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms