RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373159.1

TRAPPC3-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-201ENST00000373159 RREB1Q92766 1687 aa18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC3-201ENST00000373159 QRICH2Q9H0J4 1663 aa18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC3-201ENST00000373159 BCL9O00512 1426 aa18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC3-201ENST00000373159 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC3-201ENST00000373159 PTF1AQ7RTS3 328 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC3-201ENST00000373159 NUP188Q5SRE5 1749 aa18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC3-201ENST00000373159 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC3-201ENST00000373159 PROM2Q8N271 834 aa18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC3-201ENST00000373159 COL18A1P39060 1754 aa18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC3-201ENST00000373159 PEAK1Q9H792 1746 aa18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC3-201ENST00000373159 EXOC5O00471 708 aa18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC3-201ENST00000373159 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC3-201ENST00000373159 NEUROD1Q13562 356 aa18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC3-201ENST00000373159 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC3-201ENST00000373159 PIK3C2AO00443 1686 aa18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC3-201ENST00000373159 SOX12O15370 315 aa18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC3-201ENST00000373159 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
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TRAPPC3-201ENST00000373159 NINLQ9Y2I6 1382 aa18.67■□□□□ 0.58
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TRAPPC3-201ENST00000373159 YY1P25490 414 aa18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC3-201ENST00000373159 TXNRD1Q16881 649 aa18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC3-201ENST00000373159 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa18.65■□□□□ 0.58
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TRAPPC3-201ENST00000373159 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC3-201ENST00000373159 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP18.64■□□□□ 0.57
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TRAPPC3-201ENST00000373159 NFAT5O94916 1531 aa18.64■□□□□ 0.57
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TRAPPC3-201ENST00000373159 NME9Q86XW9 330 aa18.61■□□□□ 0.57
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TRAPPC3-201ENST00000373159 NLRP2Q9NX02 1062 aa18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC3-201ENST00000373159 AKAP12Q02952 1782 aa18.6■□□□□ 0.57
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TRAPPC3-201ENST00000373159 ZBTB7AO95365 584 aa18.6■□□□□ 0.57
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TRAPPC3-201ENST00000373159 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa18.59■□□□□ 0.57
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TRAPPC3-201ENST00000373159 ANKRD24Q8TF21 1146 aa18.57■□□□□ 0.56
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TRAPPC3-201ENST00000373159 SGIP1Q9BQI5 828 aa18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC3-201ENST00000373159 SYT17Q9BSW7 474 aa18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC3-201ENST00000373159 A0A1W2PP64 1363 aa18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC3-201ENST00000373159 USP54Q70EL1 1684 aa18.5■□□□□ 0.55
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TRAPPC3-201ENST00000373159 TONSLQ96HA7 1378 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-201ENST00000373159 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-201ENST00000373159 ARXQ96QS3 562 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-201ENST00000373159 NHSQ6T4R5 1651 aa18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC3-201ENST00000373159 SLC27A3Q5K4L6 730 aa18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC3-201ENST00000373159 COG3Q96JB2 828 aa18.46■□□□□ 0.55
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TRAPPC3-201ENST00000373159 AKT1S1Q96B36 256 aa18.45■□□□□ 0.54
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TRAPPC3-201ENST00000373159 MAP3K19Q56UN5 1328 aa18.44■□□□□ 0.54
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TRAPPC3-201ENST00000373159 MAP3K5Q99683 1374 aa18.42■□□□□ 0.54
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TRAPPC3-201ENST00000373159 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC3-201ENST00000373159 PAPPAQ13219 1627 aa18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC3-201ENST00000373159 FBLN1P23142 703 aa18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC3-201ENST00000373159 BTAF1O14981 1849 aa18.39■□□□□ 0.54
TRAPPC3-201ENST00000373159 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC3-201ENST00000373159 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC3-201ENST00000373159 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC3-201ENST00000373159 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC3-201ENST00000373159 FYB1O15117 783 aa18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC3-201ENST00000373159 POLD1P28340 1107 aa18.37■□□□□ 0.53
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