RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330687.8

CMTM4-201, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 3,414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-201ENST00000330687 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
CMTM4-201ENST00000330687 DRC7Q8IY82 874 aa24.99■■□□□ 1.59
CMTM4-201ENST00000330687 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
CMTM4-201ENST00000330687 FBLN1P23142 703 aa24.99■■□□□ 1.59
CMTM4-201ENST00000330687 TSPYL6Q8N831 410 aa24.99■■□□□ 1.59
CMTM4-201ENST00000330687 TMX3Q96JJ7 454 aa24.99■■□□□ 1.59
CMTM4-201ENST00000330687 KIAA0556O60303 1618 aa24.98■■□□□ 1.59
CMTM4-201ENST00000330687 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
CMTM4-201ENST00000330687 HMOX1P09601 288 aa24.98■■□□□ 1.59
CMTM4-201ENST00000330687 SDSP20132 328 aa24.98■■□□□ 1.59
CMTM4-201ENST00000330687 KCNJ4P48050 445 aa24.98■■□□□ 1.59
CMTM4-201ENST00000330687 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.97■■□□□ 1.59
CMTM4-201ENST00000330687 CABP2Q9NPB3 220 aa24.97■■□□□ 1.59
CMTM4-201ENST00000330687 NUP160Q12769 1436 aa24.97■■□□□ 1.59
CMTM4-201ENST00000330687 FIBPO43427 364 aa24.96■■□□□ 1.59
CMTM4-201ENST00000330687 NPHP1O15259 732 aa24.96■■□□□ 1.59
CMTM4-201ENST00000330687 PHF14O94880 888 aa24.96■■□□□ 1.59
CMTM4-201ENST00000330687 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
CMTM4-201ENST00000330687 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.59
CMTM4-201ENST00000330687 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
CMTM4-201ENST00000330687 USP48Q86UV5 1035 aa24.95■■□□□ 1.58
CMTM4-201ENST00000330687 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa24.95■■□□□ 1.58
CMTM4-201ENST00000330687 TTC22Q5TAA0 569 aa24.95■■□□□ 1.58
CMTM4-201ENST00000330687 PYCARDQ9ULZ3 195 aa24.95■■□□□ 1.58
CMTM4-201ENST00000330687 CHMP4AQ9BY43 222 aa24.94■■□□□ 1.58
CMTM4-201ENST00000330687 GIMAP6Q6P9H5 292 aa24.94■■□□□ 1.58
CMTM4-201ENST00000330687 ANO2Q9NQ90 1003 aa24.94■■□□□ 1.58
CMTM4-201ENST00000330687 SYNMO15061 1565 aa24.93■■□□□ 1.58
CMTM4-201ENST00000330687 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CMTM4-201ENST00000330687 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.93■■□□□ 1.58
CMTM4-201ENST00000330687 REC8O95072 547 aa24.93■■□□□ 1.58
CMTM4-201ENST00000330687 IFT57Q9NWB7 429 aa24.93■■□□□ 1.58
CMTM4-201ENST00000330687 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
CMTM4-201ENST00000330687 STK26Q9P289 416 aa24.92■■□□□ 1.58
CMTM4-201ENST00000330687 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.92■■□□□ 1.58
CMTM4-201ENST00000330687 RILPL2Q969X0 211 aa24.92■■□□□ 1.58
CMTM4-201ENST00000330687 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.58
CMTM4-201ENST00000330687 V9GYY5 206 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
CMTM4-201ENST00000330687 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.92■■□□□ 1.58
CMTM4-201ENST00000330687 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.91■■□□□ 1.58
CMTM4-201ENST00000330687 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa24.91■■□□□ 1.58
CMTM4-201ENST00000330687 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
CMTM4-201ENST00000330687 PLXNC1O60486 1568 aa24.9■■□□□ 1.58
CMTM4-201ENST00000330687 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.89■■□□□ 1.58
CMTM4-201ENST00000330687 TMEM51Q9NW97 253 aa24.89■■□□□ 1.58
CMTM4-201ENST00000330687 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.89■■□□□ 1.58
CMTM4-201ENST00000330687 CNPY2Q9Y2B0 182 aa24.89■■□□□ 1.57
CMTM4-201ENST00000330687 KIF3BO15066 747 aa24.88■■□□□ 1.57
CMTM4-201ENST00000330687 PRKAR2BP31323 418 aa24.88■■□□□ 1.57
CMTM4-201ENST00000330687 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
CMTM4-201ENST00000330687 ERVK-7P63135 1459 aa24.86■■□□□ 1.57
CMTM4-201ENST00000330687 ERC2O15083 957 aa24.86■■□□□ 1.57
CMTM4-201ENST00000330687 AFAP1Q8N556 730 aa24.86■■□□□ 1.57
CMTM4-201ENST00000330687 SLC24A1O60721 1099 aa24.85■■□□□ 1.57
CMTM4-201ENST00000330687 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.85■■□□□ 1.57
CMTM4-201ENST00000330687 ATP10BO94823 1461 aa24.85■■□□□ 1.57
CMTM4-201ENST00000330687 GRIN2AQ12879 1464 aa24.84■■□□□ 1.57
CMTM4-201ENST00000330687 SLC4A10Q6U841 1118 aa24.84■■□□□ 1.57
CMTM4-201ENST00000330687 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
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CMTM4-201ENST00000330687 PALD1Q9ULE6 856 aa24.83■■□□□ 1.56
CMTM4-201ENST00000330687 ABCC11Q96J66 1382 aa24.83■■□□□ 1.56
CMTM4-201ENST00000330687 ADAMTS12P58397 1594 aa24.83■■□□□ 1.56
CMTM4-201ENST00000330687 BRD1O95696 1058 aa24.82■■□□□ 1.56
CMTM4-201ENST00000330687 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CMTM4-201ENST00000330687 DCTN1Q14203 1278 aa24.82■■□□□ 1.56
CMTM4-201ENST00000330687 CAMK4Q16566 473 aa24.82■■□□□ 1.56
CMTM4-201ENST00000330687 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.81■■□□□ 1.56
CMTM4-201ENST00000330687 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.81■■□□□ 1.56
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CMTM4-201ENST00000330687 KDM4AO75164 1064 aa24.81■■□□□ 1.56
CMTM4-201ENST00000330687 LRMPQ12912 555 aa24.81■■□□□ 1.56
CMTM4-201ENST00000330687 FAM184AQ8NB25 1140 aa24.81■■□□□ 1.56
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CMTM4-201ENST00000330687 KRT24Q2M2I5 525 aa24.8■■□□□ 1.56
CMTM4-201ENST00000330687 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24.8■■□□□ 1.56
CMTM4-201ENST00000330687 CCDC183Q5T5S1 534 aa24.8■■□□□ 1.56
CMTM4-201ENST00000330687 SYNJ2O15056 1496 aa24.8■■□□□ 1.56
CMTM4-201ENST00000330687 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.8■■□□□ 1.56
CMTM4-201ENST00000330687 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CMTM4-201ENST00000330687 CD109Q6YHK3 1445 aa24.8■■□□□ 1.56
CMTM4-201ENST00000330687 MCCP23508 829 aa24.8■■□□□ 1.56
CMTM4-201ENST00000330687 VAMP4O75379 141 aa24.79■■□□□ 1.56
CMTM4-201ENST00000330687 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
CMTM4-201ENST00000330687 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.78■■□□□ 1.56
CMTM4-201ENST00000330687 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa24.78■■□□□ 1.56
CMTM4-201ENST00000330687 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP24.78■■□□□ 1.56
CMTM4-201ENST00000330687 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.78■■□□□ 1.56
CMTM4-201ENST00000330687 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.78■■□□□ 1.56
CMTM4-201ENST00000330687 KCNF1Q9H3M0 494 aa24.77■■□□□ 1.56
CMTM4-201ENST00000330687 CERS3Q8IU89 383 aa24.77■■□□□ 1.56
CMTM4-201ENST00000330687 KIAA1524Q8TCG1 905 aa24.77■■□□□ 1.56
CMTM4-201ENST00000330687 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa24.77■■□□□ 1.56
CMTM4-201ENST00000330687 TNNT1P13805 278 aa24.77■■□□□ 1.56
CMTM4-201ENST00000330687 PTPRTO14522 1441 aa24.76■■□□□ 1.55
CMTM4-201ENST00000330687 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.76■■□□□ 1.55
CMTM4-201ENST00000330687 OGFRQ9NZT2 677 aa24.76■■□□□ 1.55
CMTM4-201ENST00000330687 NOS1P29475 1434 aa24.76■■□□□ 1.55
CMTM4-201ENST00000330687 KANK1Q14678 1352 aa24.76■■□□□ 1.55
CMTM4-201ENST00000330687 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
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