RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327307.11

RRN3-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-202ENST00000327307 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa8.62□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa8.62□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa8.62□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 TERF1P54274 439 aa8.62□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 TMEM88BA6NKF7 163 aa8.61□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 TIMM44O43615 452 aa8.61□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 MARSP56192 900 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 AGBL1Q96MI9 1066 aa8.61□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 PCDH12Q9NPG4 1184 aa8.61□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 SPDYE2BA6NHP3 402 aa8.61□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 SPDYE5A6NIY4 337 aa8.61□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 SPDYE6P0CI01 402 aa8.61□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 SPDYE2Q495Y8 402 aa8.61□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 TMC2Q8TDI7 906 aa8.61□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 ARHGEF11O15085 1522 aa8.61□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 FLT3P36888 993 aa8.6□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 STAG1Q8WVM7 1258 aa8.6□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 LRRC27Q9C0I9 530 aa8.6□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 SMC3Q9UQE7 1217 aa8.6□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 DNMBPQ6XZF7 1577 aa8.6□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 POM121CA8CG34 1229 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 MS4A1P11836 297 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 ZSCAN30Q86W11 494 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 SATB1Q01826 763 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 POU5F1BQ06416 359 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 AMHR2Q16671 573 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa8.59□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RRN3-202ENST00000327307 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 LDHCP07864 332 aa8.58□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 UBE4AQ14139 1066 aa8.58□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 KCTD2Q14681 263 aa8.58□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 MIER1Q8N108 512 aa8.58□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 PIK3R5Q8WYR1 880 aa8.58□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 ZHX3Q9H4I2 956 aa8.58□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 ANAPC4Q9UJX5 808 aa8.58□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 VGLL3A8MV65 326 aa8.58□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 HSCBQ8IWL3 235 aa8.58□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 JDP2Q8WYK2 163 aa8.58□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 MUC3BQ9H195 1237 aa8.58□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 CXorf56Q9H5V9 222 aa8.58□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 HMMRO75330 724 aa8.57□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 MAP9Q49MG5 647 aa8.57□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 CFAP70Q5T0N1 1121 aa8.57□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa8.57□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 IFT57Q9NWB7 429 aa8.57□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 FGAP02671 866 aa8.56□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa8.56□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 JAZF1Q86VZ6 243 aa8.56□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 SVIPQ8NHG7 77 aa8.56□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa8.56□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa8.56□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 AKAP2Q9Y2D5 859 aa8.56□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.042e-7■■■■■ 30
RRN3-202ENST00000327307 FAM163BP0C2L3 166 aa8.56□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 PDE6BP35913 854 aa8.56□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 USP5P45974 858 aa8.56□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 PSMD2Q13200 908 aa8.56□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 NGEFQ8N5V2 710 aa8.56□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 HIP1RO75146 1068 aa8.55□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 LDHAP00338 332 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 TGFB3P10600 412 aa8.55□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 C7P10643 843 aa8.55□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 C9orf131Q5VYM1 1079 aa8.55□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 RNF217Q8TC41 542 aa8.55□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 ITFG2Q969R8 447 aa8.55□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 BORCS6Q96GS4 357 aa8.55□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 RETREG1Q9H6L5 497 aa8.55□□□□□ -1.04
RRN3-202ENST00000327307 CASS4Q9NQ75 786 aa8.55□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms