RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa11.51□□□□□ -0.57
PGGT1B-201ENST00000296642 ACEP12821 1306 aa11.51□□□□□ -0.57
PGGT1B-201ENST00000296642 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
PGGT1B-201ENST00000296642 CHD4Q14839 1912 aa11.5□□□□□ -0.57
PGGT1B-201ENST00000296642 ADGRB1O14514 1584 aa11.5□□□□□ -0.57
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PGGT1B-201ENST00000296642 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa11.5□□□□□ -0.57
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PGGT1B-201ENST00000296642 PLEKHG3A1L390 1219 aa11.49□□□□□ -0.57
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PGGT1B-201ENST00000296642 USP19O94966 1318 aa11.48□□□□□ -0.57
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PGGT1B-201ENST00000296642 MAP3K5Q99683 1374 aa11.46□□□□□ -0.57
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PGGT1B-201ENST00000296642 PEAK1Q9H792 1746 aa11.44□□□□□ -0.58
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PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
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PGGT1B-201ENST00000296642 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa11.43□□□□□ -0.58
PGGT1B-201ENST00000296642 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa11.43□□□□□ -0.58
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC7Q96M83 1385 aa11.42□□□□□ -0.58
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PGGT1B-201ENST00000296642 PROM2Q8N271 834 aa11.42□□□□□ -0.58
PGGT1B-201ENST00000296642 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
PGGT1B-201ENST00000296642 CARD10Q9BWT7 1032 aa11.42□□□□□ -0.58
PGGT1B-201ENST00000296642 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
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PGGT1B-201ENST00000296642 QRICH2Q9H0J4 1663 aa11.34□□□□□ -0.59
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PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
PGGT1B-201ENST00000296642 AXIN2Q9Y2T1 843 aa11.34□□□□□ -0.59
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PGGT1B-201ENST00000296642 SOX12O15370 315 aa11.33□□□□□ -0.6
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PGGT1B-201ENST00000296642 COL18A1P39060 1754 aa11.32□□□□□ -0.6
PGGT1B-201ENST00000296642 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-201ENST00000296642 HSPA6P17066 643 aa11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-201ENST00000296642 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-201ENST00000296642 UTRNP46939 3433 aa11.31□□□□□ -0.6
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PGGT1B-201ENST00000296642 AKT1S1Q96B36 256 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-201ENST00000296642 QSER1Q2KHR3 1735 aa11.29□□□□□ -0.6
PGGT1B-201ENST00000296642 KAT6BQ8WYB5 2073 aa11.29□□□□□ -0.6
PGGT1B-201ENST00000296642 PAPPAQ13219 1627 aa11.29□□□□□ -0.6
PGGT1B-201ENST00000296642 PIK3C2AO00443 1686 aa11.29□□□□□ -0.6
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP10DQ9P241 1426 aa11.28□□□□□ -0.6
PGGT1B-201ENST00000296642 FLAD1Q8NFF5 587 aa11.28□□□□□ -0.6
PGGT1B-201ENST00000296642 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
PGGT1B-201ENST00000296642 SHANK3Q9BYB0 1731 aa11.28□□□□□ -0.6
PGGT1B-201ENST00000296642 ERBB3P21860 1342 aa11.28□□□□□ -0.6
PGGT1B-201ENST00000296642 BTAF1O14981 1849 aa11.28□□□□□ -0.6
PGGT1B-201ENST00000296642 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC4BQ9NT99 713 aa11.27□□□□□ -0.61
PGGT1B-201ENST00000296642 CD2APQ9Y5K6 639 aa11.27□□□□□ -0.61
PGGT1B-201ENST00000296642 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa11.27□□□□□ -0.61
PGGT1B-201ENST00000296642 RGPD5Q99666 1765 aa11.26□□□□□ -0.61
PGGT1B-201ENST00000296642 NBPF1Q3BBV0 1214 aa11.26□□□□□ -0.61
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