RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295797.4

PRKCI-201, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKCI, Length 4,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-201ENST00000295797 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.25■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.25■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.25■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 NFE2L2Q16236 605 aa22.25■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.25■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 PSME1Q06323 249 aa22.24■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.24■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 RDXP35241 583 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 IQGAP2Q13576 1575 aa22.23■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 STK3Q13188 491 aa22.23■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.23■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.22■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.22■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.22■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.22■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.22■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 CAGE1Q8TC20 777 aa22.22■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.22■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 WASHC4Q2M389 1173 aa22.21■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 DCTN1Q14203 1278 aa22.21■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 KDM4AO75164 1064 aa22.2■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.15
PRKCI-201ENST00000295797 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PRKCI-201ENST00000295797 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.2■■□□□ 1.14
PRKCI-201ENST00000295797 TNMDQ9H2S6 317 aa22.2■■□□□ 1.14
PRKCI-201ENST00000295797 KRT85P78386 507 aa22.19■■□□□ 1.14
PRKCI-201ENST00000295797 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.19■■□□□ 1.14
PRKCI-201ENST00000295797 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PRKCI-201ENST00000295797 PANK2Q9BZ23 570 aa22.18■■□□□ 1.14
PRKCI-201ENST00000295797 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.18■■□□□ 1.14
PRKCI-201ENST00000295797 TSPYL1Q9H0U9 437 aa22.18■■□□□ 1.14
PRKCI-201ENST00000295797 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.18■■□□□ 1.14
PRKCI-201ENST00000295797 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PRKCI-201ENST00000295797 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
PRKCI-201ENST00000295797 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PRKCI-201ENST00000295797 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.18■■□□□ 1.14
PRKCI-201ENST00000295797 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.18■■□□□ 1.14
PRKCI-201ENST00000295797 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.18■■□□□ 1.14
PRKCI-201ENST00000295797 IFT140Q96RY7 1462 aa22.18■■□□□ 1.14
PRKCI-201ENST00000295797 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.17■■□□□ 1.14
PRKCI-201ENST00000295797 SRGAP3O43295 1099 aa22.16■■□□□ 1.14
PRKCI-201ENST00000295797 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.16■■□□□ 1.14
PRKCI-201ENST00000295797 ERICH2A1L162 156 aa22.16■■□□□ 1.14
PRKCI-201ENST00000295797 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.16■■□□□ 1.14
PRKCI-201ENST00000295797 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PRKCI-201ENST00000295797 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PRKCI-201ENST00000295797 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.15■■□□□ 1.14
PRKCI-201ENST00000295797 SIL1Q9H173 461 aa22.15■■□□□ 1.14
PRKCI-201ENST00000295797 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.15■■□□□ 1.14
PRKCI-201ENST00000295797 CUL7Q14999 1698 aa22.15■■□□□ 1.14
PRKCI-201ENST00000295797 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.15■■□□□ 1.14
PRKCI-201ENST00000295797 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PRKCI-201ENST00000295797 PRM3Q9NNZ6 103 aa22.15■■□□□ 1.14
PRKCI-201ENST00000295797 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.15■■□□□ 1.14
PRKCI-201ENST00000295797 MCM10Q7L590 875 aa22.15■■□□□ 1.14
PRKCI-201ENST00000295797 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.14■■□□□ 1.13
PRKCI-201ENST00000295797 HIP1O00291 1037 aa22.14■■□□□ 1.13
PRKCI-201ENST00000295797 ABTB2Q8N961 1025 aa22.14■■□□□ 1.13
PRKCI-201ENST00000295797 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.14■■□□□ 1.13
PRKCI-201ENST00000295797 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.13■■□□□ 1.13
PRKCI-201ENST00000295797 SKIDA1Q1XH10 827 aa22.13■■□□□ 1.13
PRKCI-201ENST00000295797 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.13■■□□□ 1.13
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PRKCI-201ENST00000295797 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PRKCI-201ENST00000295797 STK38Q15208 465 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKCI-201ENST00000295797 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKCI-201ENST00000295797 OFD1O75665 1012 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKCI-201ENST00000295797 FILIP1LQ4L180 1135 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKCI-201ENST00000295797 TAF3Q5VWG9 929 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKCI-201ENST00000295797 FERMT3Q86UX7 667 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKCI-201ENST00000295797 TNNQ9UQP3 1299 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKCI-201ENST00000295797 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKCI-201ENST00000295797 SMARCE1Q969G3 411 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKCI-201ENST00000295797 SEC24BO95487 1268 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKCI-201ENST00000295797 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKCI-201ENST00000295797 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKCI-201ENST00000295797 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.11■■□□□ 1.13
PRKCI-201ENST00000295797 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.11■■□□□ 1.13
PRKCI-201ENST00000295797 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.11■■□□□ 1.13
PRKCI-201ENST00000295797 ABCC11Q96J66 1382 aa22.11■■□□□ 1.13
PRKCI-201ENST00000295797 MX1P20591 662 aa22.11■■□□□ 1.13
PRKCI-201ENST00000295797 SPATA32Q96LK8 384 aa22.11■■□□□ 1.13
PRKCI-201ENST00000295797 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.11■■□□□ 1.13
PRKCI-201ENST00000295797 SERPINC1P01008 464 aa22.1■■□□□ 1.13
PRKCI-201ENST00000295797 ATP2B1P20020 1258 aa22.1■■□□□ 1.13
PRKCI-201ENST00000295797 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.1■■□□□ 1.13
PRKCI-201ENST00000295797 ERICH4A6NGS2 130 aa22.1■■□□□ 1.13
PRKCI-201ENST00000295797 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.1■■□□□ 1.13
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PRKCI-201ENST00000295797 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PRKCI-201ENST00000295797 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PRKCI-201ENST00000295797 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms