RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291574.8

TRAPPC10-201, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 6,976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-201ENST00000291574 ERICH4A6NGS2 130 aa16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC10-201ENST00000291574 SSFA2P28290 1259 aa16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC10-201ENST00000291574 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC10-201ENST00000291574 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC10-201ENST00000291574 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC10-201ENST00000291574 SMARCE1Q969G3 411 aa16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC10-201ENST00000291574 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC10-201ENST00000291574 CAMK4Q16566 473 aa16.14■□□□□ 0.18
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TRAPPC10-201ENST00000291574 CBX1P83916 185 aa16.14■□□□□ 0.17
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TRAPPC10-201ENST00000291574 PDRG1Q9NUG6 133 aa16.14■□□□□ 0.17
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TRAPPC10-201ENST00000291574 ERC1Q8IUD2 1116 aa16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC10-201ENST00000291574 FBXO3Q9UK99 471 aa16.14■□□□□ 0.17
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TRAPPC10-201ENST00000291574 ABTB2Q8N961 1025 aa16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC10-201ENST00000291574 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa16.12■□□□□ 0.17
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TRAPPC10-201ENST00000291574 AACSQ86V21 672 aa16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC10-201ENST00000291574 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
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TRAPPC10-201ENST00000291574 NUTM1Q86Y26 1132 aa16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC10-201ENST00000291574 CDK19Q9BWU1 502 aa16.1■□□□□ 0.17
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TRAPPC10-201ENST00000291574 CCDC83Q8IWF9 413 aa16.1■□□□□ 0.17
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TRAPPC10-201ENST00000291574 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC10-201ENST00000291574 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.09■□□□□ 0.17
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TRAPPC10-201ENST00000291574 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC10-201ENST00000291574 PPP6R1Q9UPN7 881 aa16.09■□□□□ 0.17
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TRAPPC10-201ENST00000291574 MIS18AQ9NYP9 233 aa16.08■□□□□ 0.16
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TRAPPC10-201ENST00000291574 DUSP27Q5VZP5 1158 aa16.07■□□□□ 0.16
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TRAPPC10-201ENST00000291574 FCHSD2O94868 740 aa16.07■□□□□ 0.16
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TRAPPC10-201ENST00000291574 PODXL2Q9NZ53 605 aa16.06■□□□□ 0.16
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TRAPPC10-201ENST00000291574 CCDC158Q5M9N0 1113 aa16.06■□□□□ 0.16
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TRAPPC10-201ENST00000291574 CFAP100Q494V2 611 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC10-201ENST00000291574 PDCL3Q9H2J4 239 aa16.05■□□□□ 0.16
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TRAPPC10-201ENST00000291574 NFE2L2Q16236 605 aa16.05■□□□□ 0.16
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TRAPPC10-201ENST00000291574 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC10-201ENST00000291574 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
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TRAPPC10-201ENST00000291574 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC10-201ENST00000291574 CCDC102AQ96A19 550 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC10-201ENST00000291574 MYL6BP14649 208 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC10-201ENST00000291574 MX1P20591 662 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC10-201ENST00000291574 TRIM22Q8IYM9 498 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC10-201ENST00000291574 NSD3Q9BZ95 1437 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC10-201ENST00000291574 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC10-201ENST00000291574 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC10-201ENST00000291574 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC10-201ENST00000291574 TIAM1Q13009 1591 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC10-201ENST00000291574 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC10-201ENST00000291574 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC10-201ENST00000291574 CENPHQ9H3R5 247 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC10-201ENST00000291574 CCDC183Q5T5S1 534 aa16.04■□□□□ 0.16
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