RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 ZNF521Q96K83 1311 aa27.42■■□□□ 1.98
PITX1-201ENST00000265340 DIP2AQ14689 1571 aa27.41■■□□□ 1.98
PITX1-201ENST00000265340 KCNA6P17658 529 aa27.41■■□□□ 1.98
PITX1-201ENST00000265340 SHPRHQ149N8 1683 aa27.4■■□□□ 1.98
PITX1-201ENST00000265340 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
PITX1-201ENST00000265340 APAF1O14727 1248 aa27.39■■□□□ 1.97
PITX1-201ENST00000265340 MTHFSP49914 203 aa27.39■■□□□ 1.97
PITX1-201ENST00000265340 GAS2L3Q86XJ1 694 aa27.39■■□□□ 1.97
PITX1-201ENST00000265340 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.97
PITX1-201ENST00000265340 CABP1Q9NZU7 370 aa27.38■■□□□ 1.97
PITX1-201ENST00000265340 NSD2O96028 1365 aa27.38■■□□□ 1.97
PITX1-201ENST00000265340 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
PITX1-201ENST00000265340 TBC1D32Q96NH3 1257 aa27.37■■□□□ 1.97
PITX1-201ENST00000265340 TECPR2O15040 1411 aa27.37■■□□□ 1.97
PITX1-201ENST00000265340 HS1BP3Q53T59 392 aa27.37■■□□□ 1.97
PITX1-201ENST00000265340 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
PITX1-201ENST00000265340 GGNBP2Q9H3C7 697 aa27.36■■□□□ 1.97
PITX1-201ENST00000265340 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa27.36■■□□□ 1.97
PITX1-201ENST00000265340 STRCQ7RTU9 1775 aa27.36■■□□□ 1.97
PITX1-201ENST00000265340 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
PITX1-201ENST00000265340 TERF2IPQ9NYB0 399 aa27.35■■□□□ 1.97
PITX1-201ENST00000265340 CPS1P31327 1500 aa27.35■■□□□ 1.97
PITX1-201ENST00000265340 KNDC1Q76NI1 1749 aa27.34■■□□□ 1.97
PITX1-201ENST00000265340 TAF3Q5VWG9 929 aa27.33■■□□□ 1.97
PITX1-201ENST00000265340 FYB1O15117 783 aa27.33■■□□□ 1.97
PITX1-201ENST00000265340 DUSP27Q5VZP5 1158 aa27.32■■□□□ 1.96
PITX1-201ENST00000265340 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
PITX1-201ENST00000265340 FAM135BQ49AJ0 1406 aa27.31■■□□□ 1.96
PITX1-201ENST00000265340 PIK3R4Q99570 1358 aa27.31■■□□□ 1.96
PITX1-201ENST00000265340 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
PITX1-201ENST00000265340 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
PITX1-201ENST00000265340 GOLGA2Q08379 1002 aa27.3■■□□□ 1.96
PITX1-201ENST00000265340 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
PITX1-201ENST00000265340 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
PITX1-201ENST00000265340 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa27.29■■□□□ 1.96
PITX1-201ENST00000265340 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
PITX1-201ENST00000265340 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
PITX1-201ENST00000265340 SIRT1Q96EB6 747 aa27.28■■□□□ 1.96
PITX1-201ENST00000265340 ARID3AQ99856 593 aa27.28■■□□□ 1.96
PITX1-201ENST00000265340 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
PITX1-201ENST00000265340 WASLO00401 505 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
PITX1-201ENST00000265340 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.27■■□□□ 1.96
PITX1-201ENST00000265340 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
PITX1-201ENST00000265340 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
PITX1-201ENST00000265340 PTMSP20962 102 aa27.26■■□□□ 1.95
PITX1-201ENST00000265340 NASPP49321 788 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
PITX1-201ENST00000265340 SLFN5Q08AF3 891 aa27.26■■□□□ 1.95
PITX1-201ENST00000265340 PTCH1Q13635 1447 aa27.26■■□□□ 1.95
PITX1-201ENST00000265340 SASS6Q6UVJ0 657 aa27.26■■□□□ 1.95
PITX1-201ENST00000265340 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
PITX1-201ENST00000265340 NUTM2FA1L443 756 aa27.25■■□□□ 1.95
PITX1-201ENST00000265340 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa27.25■■□□□ 1.95
PITX1-201ENST00000265340 CFAP53Q96M91 514 aa27.24■■□□□ 1.95
PITX1-201ENST00000265340 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
PITX1-201ENST00000265340 ATP7BP35670 1465 aa27.21■■□□□ 1.95
PITX1-201ENST00000265340 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP27.21■■□□□ 1.95
PITX1-201ENST00000265340 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
PITX1-201ENST00000265340 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa27.21■■□□□ 1.95
PITX1-201ENST00000265340 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
PITX1-201ENST00000265340 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa27.2■■□□□ 1.94
PITX1-201ENST00000265340 RUNDC1Q96C34 613 aa27.2■■□□□ 1.94
PITX1-201ENST00000265340 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
PITX1-201ENST00000265340 KIF20BQ96Q89 1820 aa27.2■■□□□ 1.94
PITX1-201ENST00000265340 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
PITX1-201ENST00000265340 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
PITX1-201ENST00000265340 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.18■■□□□ 1.94
PITX1-201ENST00000265340 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
PITX1-201ENST00000265340 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
PITX1-201ENST00000265340 NEUROD2Q15784 382 aa27.18■■□□□ 1.94
PITX1-201ENST00000265340 C14orf37Q86TY3 774 aa27.18■■□□□ 1.94
PITX1-201ENST00000265340 WWC1Q8IX03 1113 aa27.18■■□□□ 1.94
PITX1-201ENST00000265340 TCP11L2Q8N4U5 519 aa27.18■■□□□ 1.94
PITX1-201ENST00000265340 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.18■■□□□ 1.94
PITX1-201ENST00000265340 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
PITX1-201ENST00000265340 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
PITX1-201ENST00000265340 FBLN1P23142 703 aa27.17■■□□□ 1.94
PITX1-201ENST00000265340 MCM5P33992 734 aa27.17■■□□□ 1.94
PITX1-201ENST00000265340 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
PITX1-201ENST00000265340 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
PITX1-201ENST00000265340 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP27.16■■□□□ 1.94
PITX1-201ENST00000265340 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
PITX1-201ENST00000265340 PRR36Q9H6K5 1346 aa27.15■■□□□ 1.94
PITX1-201ENST00000265340 NWD1Q149M9 1564 aa27.15■■□□□ 1.94
PITX1-201ENST00000265340 VGLL3A8MV65 326 aa27.15■■□□□ 1.94
PITX1-201ENST00000265340 IGHDP01880 384 aa27.15■■□□□ 1.94
PITX1-201ENST00000265340 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa27.14■■□□□ 1.94
PITX1-201ENST00000265340 DDIT3P35638 169 aa27.14■■□□□ 1.94
PITX1-201ENST00000265340 NGEFQ8N5V2 710 aa27.14■■□□□ 1.94
PITX1-201ENST00000265340 GBP4Q96PP9 640 aa27.14■■□□□ 1.94
PITX1-201ENST00000265340 E9PSI1 815 aa27.12■■□□□ 1.93
PITX1-201ENST00000265340 CCDC61Q9Y6R9 512 aa27.12■■□□□ 1.93
PITX1-201ENST00000265340 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
PITX1-201ENST00000265340 ZRANB1Q9UGI0 708 aa27.1■■□□□ 1.93
PITX1-201ENST00000265340 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa27.1■■□□□ 1.93
PITX1-201ENST00000265340 NALCNQ8IZF0 1738 aa27.1■■□□□ 1.93
PITX1-201ENST00000265340 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
PITX1-201ENST00000265340 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa27.1■■□□□ 1.93
PITX1-201ENST00000265340 PLCD3Q8N3E9 789 aa27.1■■□□□ 1.93
PITX1-201ENST00000265340 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
PITX1-201ENST00000265340 NME9Q86XW9 330 aa27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91 ms