RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
ODC1-201ENST00000234111 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.01■■□□□ 1.75
ODC1-201ENST00000234111 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
ODC1-201ENST00000234111 PIBF1Q8WXW3 757 aa26.01■■□□□ 1.75
ODC1-201ENST00000234111 TSPY26PQ9H489 355 aa26.01■■□□□ 1.75
ODC1-201ENST00000234111 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP26■■□□□ 1.751e-6■■□□□ 13
ODC1-201ENST00000234111 USP26Q9BXU7 913 aa26■■□□□ 1.75
ODC1-201ENST00000234111 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
ODC1-201ENST00000234111 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
ODC1-201ENST00000234111 SIRT2Q8IXJ6 389 aa26■■□□□ 1.75
ODC1-201ENST00000234111 SPDYE4A6NLX3 237 aa25.99■■□□□ 1.75
ODC1-201ENST00000234111 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
ODC1-201ENST00000234111 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.99■■□□□ 1.756e-9■■■□□ 15.7
ODC1-201ENST00000234111 KIF3AQ9Y496 699 aa25.99■■□□□ 1.75
ODC1-201ENST00000234111 MBD3O95983 291 aa25.98■■□□□ 1.75
ODC1-201ENST00000234111 PLEKHF1Q96S99 279 aa25.98■■□□□ 1.75
ODC1-201ENST00000234111 MED14O60244 1454 aa25.97■■□□□ 1.75
ODC1-201ENST00000234111 ABCA6Q8N139 1617 aa25.97■■□□□ 1.75
ODC1-201ENST00000234111 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
ODC1-201ENST00000234111 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.97■■□□□ 1.75
ODC1-201ENST00000234111 ST18O60284 1047 aa25.96■■□□□ 1.75
ODC1-201ENST00000234111 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
ODC1-201ENST00000234111 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25.95■■□□□ 1.74
ODC1-201ENST00000234111 ALDH1L2Q3SY69 923 aa25.94■■□□□ 1.74
ODC1-201ENST00000234111 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa25.94■■□□□ 1.74
ODC1-201ENST00000234111 IGSF3O75054 1194 aa25.93■■□□□ 1.74
ODC1-201ENST00000234111 IL16Q14005 1332 aa25.93■■□□□ 1.74
ODC1-201ENST00000234111 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.92■■□□□ 1.74
ODC1-201ENST00000234111 PDCL2Q8N4E4 241 aa25.91■■□□□ 1.74
ODC1-201ENST00000234111 USP25Q9UHP3 1055 aa25.91■■□□□ 1.74
ODC1-201ENST00000234111 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.91■■□□□ 1.74
ODC1-201ENST00000234111 PDE4CQ08493 712 aa25.91■■□□□ 1.74
ODC1-201ENST00000234111 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
ODC1-201ENST00000234111 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
ODC1-201ENST00000234111 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.91■■□□□ 1.74
ODC1-201ENST00000234111 TTC22Q5TAA0 569 aa25.9■■□□□ 1.74
ODC1-201ENST00000234111 REREQ9P2R6 1566 aa25.89■■□□□ 1.74
ODC1-201ENST00000234111 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
ODC1-201ENST00000234111 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP25.89■■□□□ 1.73
ODC1-201ENST00000234111 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
ODC1-201ENST00000234111 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.88■■□□□ 1.73
ODC1-201ENST00000234111 SPTLC3Q9NUV7 552 aa25.87■■□□□ 1.73
ODC1-201ENST00000234111 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
ODC1-201ENST00000234111 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.86■■□□□ 1.73
ODC1-201ENST00000234111 USP32Q8NFA0 1604 aa25.85■■□□□ 1.73
ODC1-201ENST00000234111 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
ODC1-201ENST00000234111 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
ODC1-201ENST00000234111 CFAP44Q96MT7 982 aa25.85■■□□□ 1.73
ODC1-201ENST00000234111 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
ODC1-201ENST00000234111 MYOM2P54296 1465 aa25.85■■□□□ 1.73
ODC1-201ENST00000234111 ADCY5O95622 1261 aa25.85■■□□□ 1.73
ODC1-201ENST00000234111 BRD1O95696 1058 aa25.84■■□□□ 1.73
ODC1-201ENST00000234111 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
ODC1-201ENST00000234111 GDPD2Q9HCC8 539 aa25.84■■□□□ 1.73
ODC1-201ENST00000234111 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.84■■□□□ 1.73
ODC1-201ENST00000234111 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
ODC1-201ENST00000234111 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
ODC1-201ENST00000234111 TMEM51Q9NW97 253 aa25.82■■□□□ 1.72
ODC1-201ENST00000234111 PIK3R4Q99570 1358 aa25.82■■□□□ 1.72
ODC1-201ENST00000234111 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
ODC1-201ENST00000234111 SDSP20132 328 aa25.81■■□□□ 1.72
ODC1-201ENST00000234111 TMX3Q96JJ7 454 aa25.81■■□□□ 1.72
ODC1-201ENST00000234111 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
ODC1-201ENST00000234111 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.81■■□□□ 1.72
ODC1-201ENST00000234111 PHF14O94880 888 aa25.81■■□□□ 1.72
ODC1-201ENST00000234111 UVSSAQ2YD98 709 aa25.81■■□□□ 1.72
ODC1-201ENST00000234111 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.81■■□□□ 1.72
ODC1-201ENST00000234111 FAM184AQ8NB25 1140 aa25.81■■□□□ 1.72
ODC1-201ENST00000234111 ANKRD7Q92527 254 aa25.8■■□□□ 1.72
ODC1-201ENST00000234111 PTCH1Q13635 1447 aa25.79■■□□□ 1.72
ODC1-201ENST00000234111 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
ODC1-201ENST00000234111 NEK4P51957 841 aa25.78■■□□□ 1.72
ODC1-201ENST00000234111 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.78■■□□□ 1.72
ODC1-201ENST00000234111 CASC1Q6TDU7 716 aa25.78■■□□□ 1.72
ODC1-201ENST00000234111 AFAP1Q8N556 730 aa25.78■■□□□ 1.72
ODC1-201ENST00000234111 ASXL2Q76L83 1435 aa25.78■■□□□ 1.72
ODC1-201ENST00000234111 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
ODC1-201ENST00000234111 NSD2O96028 1365 aa25.78■■□□□ 1.72
ODC1-201ENST00000234111 PLCH2O75038 1416 aa25.78■■□□□ 1.72
ODC1-201ENST00000234111 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
ODC1-201ENST00000234111 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.77■■□□□ 1.72
ODC1-201ENST00000234111 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
ODC1-201ENST00000234111 TSPYL6Q8N831 410 aa25.77■■□□□ 1.72
ODC1-201ENST00000234111 ARHGAP45Q92619 1136 aa25.77■■□□□ 1.72
ODC1-201ENST00000234111 ABCC4O15439 1325 aa25.77■■□□□ 1.72
ODC1-201ENST00000234111 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
ODC1-201ENST00000234111 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
ODC1-201ENST00000234111 DCTPP1Q9H773 170 aa25.77■■□□□ 1.72
ODC1-201ENST00000234111 VAMP4O75379 141 aa25.76■■□□□ 1.71
ODC1-201ENST00000234111 REC8O95072 547 aa25.76■■□□□ 1.71
ODC1-201ENST00000234111 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa25.76■■□□□ 1.71
ODC1-201ENST00000234111 QRICH2Q9H0J4 1663 aa25.76■■□□□ 1.71
ODC1-201ENST00000234111 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
ODC1-201ENST00000234111 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
ODC1-201ENST00000234111 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
ODC1-201ENST00000234111 TPRNQ4KMQ1 711 aa25.75■■□□□ 1.71
ODC1-201ENST00000234111 ZNF428Q96B54 188 aa25.75■■□□□ 1.71
ODC1-201ENST00000234111 PYCARDQ9ULZ3 195 aa25.75■■□□□ 1.71
ODC1-201ENST00000234111 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa25.74■■□□□ 1.71
ODC1-201ENST00000234111 PLCB2Q00722 1185 aa25.74■■□□□ 1.71
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