RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216420.11

CGRRF1-201, Transcript of cell growth regulator with ring finger domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CGRRF1, Length 2,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1-201ENST00000216420 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.6■■□□□ 1.21
CGRRF1-201ENST00000216420 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.59■■□□□ 1.21
CGRRF1-201ENST00000216420 ARID3AQ99856 593 aa22.59■■□□□ 1.21
CGRRF1-201ENST00000216420 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
CGRRF1-201ENST00000216420 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
CGRRF1-201ENST00000216420 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.21
CGRRF1-201ENST00000216420 UVSSAQ2YD98 709 aa22.58■■□□□ 1.21
CGRRF1-201ENST00000216420 USP26Q9BXU7 913 aa22.58■■□□□ 1.21
CGRRF1-201ENST00000216420 SPTLC3Q9NUV7 552 aa22.58■■□□□ 1.21
CGRRF1-201ENST00000216420 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.58■■□□□ 1.2
CGRRF1-201ENST00000216420 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
CGRRF1-201ENST00000216420 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.58■■□□□ 1.2
CGRRF1-201ENST00000216420 TAF3Q5VWG9 929 aa22.57■■□□□ 1.2
CGRRF1-201ENST00000216420 TSPY26PQ9H489 355 aa22.57■■□□□ 1.2
CGRRF1-201ENST00000216420 PTCH1Q13635 1447 aa22.57■■□□□ 1.2
CGRRF1-201ENST00000216420 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.57■■□□□ 1.2
CGRRF1-201ENST00000216420 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
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CGRRF1-201ENST00000216420 KIF1BO60333 1816 aa22.55■■□□□ 1.2
CGRRF1-201ENST00000216420 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CGRRF1-201ENST00000216420 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.55■■□□□ 1.2
CGRRF1-201ENST00000216420 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.55■■□□□ 1.2
CGRRF1-201ENST00000216420 KIF3AQ9Y496 699 aa22.55■■□□□ 1.2
CGRRF1-201ENST00000216420 ST18O60284 1047 aa22.54■■□□□ 1.2
CGRRF1-201ENST00000216420 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.2
CGRRF1-201ENST00000216420 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CGRRF1-201ENST00000216420 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CGRRF1-201ENST00000216420 ATP2B3Q16720 1220 aa22.54■■□□□ 1.2
CGRRF1-201ENST00000216420 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CGRRF1-201ENST00000216420 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CGRRF1-201ENST00000216420 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CGRRF1-201ENST00000216420 CBX1P83916 185 aa22.53■■□□□ 1.2
CGRRF1-201ENST00000216420 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
CGRRF1-201ENST00000216420 ABCC1P33527 1531 aa22.52■■□□□ 1.2
CGRRF1-201ENST00000216420 KLHL34Q8N239 644 aa22.51■■□□□ 1.19
CGRRF1-201ENST00000216420 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
CGRRF1-201ENST00000216420 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.51■■□□□ 1.19
CGRRF1-201ENST00000216420 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.5■■□□□ 1.19
CGRRF1-201ENST00000216420 PHF14O94880 888 aa22.5■■□□□ 1.19
CGRRF1-201ENST00000216420 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CGRRF1-201ENST00000216420 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.5■■□□□ 1.19
CGRRF1-201ENST00000216420 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.5■■□□□ 1.19
CGRRF1-201ENST00000216420 TTC22Q5TAA0 569 aa22.5■■□□□ 1.19
CGRRF1-201ENST00000216420 ANKRD7Q92527 254 aa22.49■■□□□ 1.19
CGRRF1-201ENST00000216420 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.48■■□□□ 1.19
CGRRF1-201ENST00000216420 RNF214Q8ND24 703 aa22.48■■□□□ 1.19
CGRRF1-201ENST00000216420 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.48■■□□□ 1.19
CGRRF1-201ENST00000216420 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.47■■□□□ 1.19
CGRRF1-201ENST00000216420 BRD1O95696 1058 aa22.47■■□□□ 1.19
CGRRF1-201ENST00000216420 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CGRRF1-201ENST00000216420 FEZ1Q99689 392 aa22.46■■□□□ 1.19
CGRRF1-201ENST00000216420 ABCC4O15439 1325 aa22.46■■□□□ 1.19
CGRRF1-201ENST00000216420 MROH2AA6NES4 1674 aa22.46■■□□□ 1.19
CGRRF1-201ENST00000216420 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.46■■□□□ 1.19
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CGRRF1-201ENST00000216420 TSC1Q92574 1164 aa22.45■■□□□ 1.18
CGRRF1-201ENST00000216420 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
CGRRF1-201ENST00000216420 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.44■■□□□ 1.18
CGRRF1-201ENST00000216420 PLCH2O75038 1416 aa22.44■■□□□ 1.18
CGRRF1-201ENST00000216420 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.44■■□□□ 1.18
CGRRF1-201ENST00000216420 ADGRB1O14514 1584 aa22.44■■□□□ 1.18
CGRRF1-201ENST00000216420 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.43■■□□□ 1.18
CGRRF1-201ENST00000216420 CTIFO43310 598 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CGRRF1-201ENST00000216420 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.43■■□□□ 1.18
CGRRF1-201ENST00000216420 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.43■■□□□ 1.18
CGRRF1-201ENST00000216420 MCM2P49736 904 aa22.43■■□□□ 1.18
CGRRF1-201ENST00000216420 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CGRRF1-201ENST00000216420 DCTPP1Q9H773 170 aa22.42■■□□□ 1.18
CGRRF1-201ENST00000216420 CUL4AQ13619 759 aa22.42■■□□□ 1.18
CGRRF1-201ENST00000216420 REC8O95072 547 aa22.41■■□□□ 1.18
CGRRF1-201ENST00000216420 CASC1Q6TDU7 716 aa22.41■■□□□ 1.18
CGRRF1-201ENST00000216420 PDE4CQ08493 712 aa22.4■■□□□ 1.18
CGRRF1-201ENST00000216420 SYCP1Q15431 976 aa22.4■■□□□ 1.18
CGRRF1-201ENST00000216420 FANCAO15360 1455 aa22.4■■□□□ 1.18
CGRRF1-201ENST00000216420 TPM3P06753 285 aa22.4■■□□□ 1.18
CGRRF1-201ENST00000216420 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CGRRF1-201ENST00000216420 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.39■■□□□ 1.17
CGRRF1-201ENST00000216420 ADGRB3O60242 1522 aa22.39■■□□□ 1.17
CGRRF1-201ENST00000216420 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CGRRF1-201ENST00000216420 TMEM51Q9NW97 253 aa22.38■■□□□ 1.17
CGRRF1-201ENST00000216420 OGFRQ9NZT2 677 aa22.38■■□□□ 1.17
CGRRF1-201ENST00000216420 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.38■■□□□ 1.17
CGRRF1-201ENST00000216420 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.37■■□□□ 1.17
CGRRF1-201ENST00000216420 ADCY5O95622 1261 aa22.37■■□□□ 1.17
CGRRF1-201ENST00000216420 KIAA1524Q8TCG1 905 aa22.37■■□□□ 1.17
CGRRF1-201ENST00000216420 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.37■■□□□ 1.17
CGRRF1-201ENST00000216420 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CGRRF1-201ENST00000216420 PPLO60437 1756 aa22.36■■□□□ 1.17
CGRRF1-201ENST00000216420 VAMP4O75379 141 aa22.36■■□□□ 1.17
CGRRF1-201ENST00000216420 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CGRRF1-201ENST00000216420 TMX3Q96JJ7 454 aa22.36■■□□□ 1.17
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CGRRF1-201ENST00000216420 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.36■■□□□ 1.17
CGRRF1-201ENST00000216420 USP25Q9UHP3 1055 aa22.35■■□□□ 1.17
CGRRF1-201ENST00000216420 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CGRRF1-201ENST00000216420 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.35■■□□□ 1.17
CGRRF1-201ENST00000216420 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.34■■□□□ 1.17
CGRRF1-201ENST00000216420 SDSP20132 328 aa22.34■■□□□ 1.17
CGRRF1-201ENST00000216420 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.34■■□□□ 1.17
CGRRF1-201ENST00000216420 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
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