RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001711.5

Hoxc6-201, Transcript of Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxc6, Length 1,581 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 InhbeO08717 350 aa24.96■■□□□ 1.59
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Fbln2P37889 1221 aa24.96■■□□□ 1.59
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rsph6aQ8CDR2 708 aa24.96■■□□□ 1.59
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 OptnQ8K3K8 584 aa24.96■■□□□ 1.59
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 CrklP47941 303 aa24.95■■□□□ 1.58
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 RgmbQ7TQ33 436 aa24.94■■□□□ 1.58
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Psrc1Q9D0P7 329 aa24.94■■□□□ 1.58
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 GsdmaQ9EST1 446 aa24.94■■□□□ 1.58
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mrs2Q5NCE8 434 aa24.93■■□□□ 1.58
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Dmrt2Q8BG36 561 aa24.93■■□□□ 1.58
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Shank2Q80Z38 1476 aa24.93■■□□□ 1.58
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Zfp777B9EKF4 885 aa24.93■■□□□ 1.58
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Eno4Q8C042 619 aa24.93■■□□□ 1.58
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 TkfcQ8VC30 578 aa24.93■■□□□ 1.58
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Slit1Q80TR4 1531 aa24.92■■□□□ 1.58
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tsen2Q6P7W5 460 aa24.92■■□□□ 1.58
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Atf7ipQ7TT18 1306 aa24.91■■□□□ 1.58
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 FocadA2AKG8 1798 aa24.91■■□□□ 1.58
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Plekhd1B2RPU2 505 aa24.89■■□□□ 1.58
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Kdm6aO70546 1401 aa24.89■■□□□ 1.57
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Eya1P97767 591 aa24.88■■□□□ 1.57
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Sf3b2Q3UJB0 878 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa24.88■■□□□ 1.57
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Zscan21Q07231 555 aa24.87■■□□□ 1.57
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tnrc6cQ3UHC0 1690 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Col15a1O35206 1367 aa24.86■■□□□ 1.57
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pak3Q61036 559 aa24.86■■□□□ 1.57
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ccdc129Q14B48 1034 aa24.85■■□□□ 1.57
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 PalmQ9Z0P4 383 aa24.85■■□□□ 1.57
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 MpripP97434 1024 aa24.84■■□□□ 1.57
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Zpr1Q62384 459 aa24.84■■□□□ 1.57
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Zranb3Q6NZP1 1069 aa24.83■■□□□ 1.57
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pm20d1Q8C165 503 aa24.83■■□□□ 1.57
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cacna1sQ02789 1880 aa24.83■■□□□ 1.56
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Kat6bQ8BRB7 1872 aa24.82■■□□□ 1.56
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Spef2Q8C9J3 1734 aa24.81■■□□□ 1.56
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gm10471E9Q1C7 252 aa24.81■■□□□ 1.56
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Fer1l6E0CZ42 1862 aa24.8■■□□□ 1.56
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 NrdcQ8BHG1 1161 aa24.8■■□□□ 1.56
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Simc1E9Q6E9 1354 aa24.8■■□□□ 1.56
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Akap11E9Q777 1895 aa24.79■■□□□ 1.56
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Fchsd2Q3USJ8 740 aa24.76■■□□□ 1.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ppp1r37Q8BKR5 712 aa24.76■■□□□ 1.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa24.76■■□□□ 1.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa24.76■■□□□ 1.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Aplp2Q06335 707 aa24.75■■□□□ 1.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa24.74■■□□□ 1.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ltbp1Q8CG19 1712 aa24.74■■□□□ 1.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 TnikP83510 1323 aa24.73■■□□□ 1.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Plin1Q8CGN5 517 aa24.73■■□□□ 1.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mast2Q60592 1734 aa24.72■■□□□ 1.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mcm10Q0VBD2 885 aa24.71■■□□□ 1.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Stk31Q99MW1 1018 aa24.71■■□□□ 1.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Esx1O88933 382 aa24.71■■□□□ 1.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa24.71■■□□□ 1.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Golga2Q921M4 999 aa24.71■■□□□ 1.55
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa24.7■■□□□ 1.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 HypkQ9CR41 129 aa24.7■■□□□ 1.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 ThemisQ8BGW0 636 aa24.69■■□□□ 1.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Vps33bP59016 617 aa24.68■■□□□ 1.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ginm1Q91WR6 327 aa24.68■■□□□ 1.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mst1rQ62190 1378 aa24.68■■□□□ 1.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa24.68■■□□□ 1.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 4930572O03RikQ8C5Y0 211 aa24.67■■□□□ 1.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Iqcf3Q9D498 203 aa24.67■■□□□ 1.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Nup153E9Q3G8 1462 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 GapdhsQ64467 440 aa24.67■■□□□ 1.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Fam50bQ9WTJ8 334 aa24.67■■□□□ 1.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ankrd23Q812A3 306 aa24.66■■□□□ 1.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Apaf1O88879 1249 aa24.65■■□□□ 1.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Nwd2Q6P5U7 1742 aa24.65■■□□□ 1.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Arfgef2A2A5R2 1792 aa24.64■■□□□ 1.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Q4VA45 678 aa24.64■■□□□ 1.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pcgf6Q99NA9 353 aa24.64■■□□□ 1.54
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tnks1bp1P58871 1720 aa24.63■■□□□ 1.53
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Znf541Q0GGX2 1363 aa24.63■■□□□ 1.53
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Kcnh4A2A5F7 1018 aa24.63■■□□□ 1.53
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Amotl1Q9D4H4 968 aa24.63■■□□□ 1.53
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Sik1Q60670 779 aa24.62■■□□□ 1.53
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ahnak2E9PYB0 1738 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cabp2Q9JLK4 216 aa24.61■■□□□ 1.53
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Exoc5Q3TPX4 708 aa24.6■■□□□ 1.53
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ddb1Q3U1J4 1140 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Speer4bQ9D9F7 267 aa24.59■■□□□ 1.53
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Trpm3Q5F4S9 1721 aa24.59■■□□□ 1.53
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gm21680A0A0G2JGR8 267 aa24.59■■□□□ 1.53
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Elp1Q7TT37 1333 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Usp19Q3UJD6 1360 aa24.58■■□□□ 1.53
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cavin4A2AMM0 362 aa24.56■■□□□ 1.52
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Uspl1Q3ULM6 1089 aa24.56■■□□□ 1.52
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tns2Q8CGB6 1400 aa24.55■■□□□ 1.52
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Taok3Q8BYC6 898 aa24.55■■□□□ 1.52
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ciz1Q8VEH2 845 aa24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 38.6 ms