RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 CNTFP26441 200 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 CPOXP36551 454 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 CD86P42081 329 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 TAS2R39P59534 338 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 PIK3R6Q5UE93 754 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 LPCAT4Q643R3 524 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 PM20D1Q6GTS8 502 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 DENND5AQ6IQ26 1287 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 FAM171BQ6P995 826 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 FAM156AQ8NDB6 213 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 OR6P1Q8NGX9 317 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 PPP2R3CQ969Q6 453 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 OSBPL10Q9BXB5 764 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 GMIPQ9P107 970 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 CRYL1Q9Y2S2 319 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa15.2■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 A0A0U1RQF3 1178 aa15.19■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 E9PAM4 449 aa15.19■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 CYBAP13498 195 aa15.19■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 PORP16435 677 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 HOXC8P31273 242 aa15.19■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 PKNOX1P55347 436 aa15.19■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 TSPY1Q01534 308 aa15.19■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 PRPSAP1Q14558 356 aa15.19■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 PTPRRQ15256 657 aa15.19■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 RAP1GAP2Q684P5 730 aa15.19■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 PSMG2Q969U7 264 aa15.19■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 NAT9Q9BTE0 207 aa15.19■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 SPC25Q9HBM1 224 aa15.19■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 GLOD4Q9HC38 313 aa15.19■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa15.19■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 MKS1Q9NXB0 559 aa15.19■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 SOX13Q9UN79 622 aa15.19■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa15.19■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 TRIM13O60858 407 aa15.19■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 KCNA5P22460 613 aa15.19■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 CCR1P32246 355 aa15.19■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 TUSC3Q13454 348 aa15.19■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 SH3TC2Q8TF17 1288 aa15.19■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 GIPC2Q8TF65 315 aa15.19■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 HMCESQ96FZ2 354 aa15.19■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 EXOC2Q96KP1 924 aa15.19■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa15.19■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 IL22Q9GZX6 179 aa15.19■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa15.19■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 TM7SF2O76062 418 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 COPAP53621 1224 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 FKBP1BP68106 108 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 TMEM259Q4ZIN3 620 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 RGMBQ6NW40 437 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 SLC45A3Q96JT2 553 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 NDEL1Q9GZM8 345 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 DLX3O60479 287 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 ATP6AP2O75787 350 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 CIB2O75838 187 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 EMP3P54852 163 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 WNT3AP56704 352 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 NAA20P61599 178 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 MGAT3Q09327 533 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 RNF111Q6ZNA4 994 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 PIM3Q86V86 326 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 ACMSDQ8TDX5 336 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 GAB3Q8WWW8 586 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 SPATA17Q96L03 361 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 TOMM70O94826 608 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 BTKQ06187 659 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 MBTPS1Q14703 1052 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 PKN3Q6P5Z2 889 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 TMC7Q7Z402 723 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 THEM5Q8N1Q8 247 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 TMEM151AQ8N4L1 468 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 RIN3Q8TB24 985 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 BHMTQ93088 406 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 IGSF8Q969P0 613 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 MRGPRX2Q96LB1 330 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 CRISPLD1Q9H336 500 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 C9JVG2 144 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-205ENST00000587860 TMED10P49755 219 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.8 ms