RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 CLN6Q9NWW5 311 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 SLC28A1O00337 649 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 PTPRAP18433 802 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 CAPSQ13938 189 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 IQSEC1Q6DN90 963 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 PIGZQ86VD9 579 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 ZYG11BQ9C0D3 744 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 HES2Q9Y543 173 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 CACUL1Q86Y37 369 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 ANKRD52Q8NB46 1076 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF540Q8NDQ6 660 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 OR5B17Q8NGF7 314 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 SLC12A4Q9UP95 1085 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 CATP04040 527 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 LINC00032P0C843 101 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 TTPAP49638 278 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF846Q147U1 533 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 AMER2Q8N7J2 671 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 NELL1Q92832 810 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 ADM5C9JUS6 153 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 ALOX15BO15296 676 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 SGTAO43765 313 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 SNAP91O60641 907 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 LSM3P62310 102 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 QPRTQ15274 297 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 CDT1Q9H211 546 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 ADGRB1O14514 1584 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 PRKAG1P54619 331 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 USP46P62068 366 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 QPCTQ16769 361 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 PNPOQ9NVS9 261 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 CST1P01037 141 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.034e-7■■■■□ 23.1
PTPRM-211ENST00000580170 EPORP19235 508 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 NAA20P61599 178 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 ECM1Q16610 540 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 AMIGO2Q86SJ2 522 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 DSG4Q86SJ6 1040 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 AKAP14Q86UN6 197 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 FAM20CQ8IXL6 584 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 MYDGFQ969H8 173 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 SLC17A7Q9P2U7 560 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 XPR1Q9UBH6 696 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 DMTF1Q9Y222 760 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 POLR1DQ9Y2S0 133 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 GUCY1B2O75343 617 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 ALOX5P09917 674 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 CTBP1Q13363 440 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 PPM1LQ5SGD2 360 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 CDYL2Q8N8U2 506 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 MOSPD2Q8NHP6 518 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 TOR4AQ9NXH8 423 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 OR6A2O95222 327 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 WARSP23381 471 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 TRABD2AQ86V40 505 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 BORCS5Q969J3 196 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 VPS35Q96QK1 796 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 PCDH12Q9NPG4 1184 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 DNMT3LQ9UJW3 386 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 C3orf18Q9UK00 162 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 DDNO94850 711 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 MYLPFQ96A32 169 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 H7C0S8 307 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 ULK1O75385 1050 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 GPR107Q5VW38 600 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 FBXL19Q6PCT2 694 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 UROC1Q96N76 676 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 PNPLA3Q9NST1 481 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 NDOR1Q9UHB4 597 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 EDF1O60869 148 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 PACS1Q6VY07 963 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 HIPK1Q86Z02 1210 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 RIOX2Q8IUF8 465 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 RHBGQ9H310 441 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 STX11O75558 287 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 HOXC6P09630 235 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 GALK1P51570 392 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 CCR4P51679 360 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 PFKPQ01813 784 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 TCF12Q99081 682 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 OSBPL11Q9BXB4 747 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa21.45■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 BMT2Q1RMZ1 405 aa21.45■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF180Q9UJW8 692 aa21.45■■□□□ 1.03
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