RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565324.5

SMG1-211, Transcript of SMG1, nonsense mediated mRNA decay associated PI3K related kinase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMG1, Length 12,465 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1-211ENST00000565324 PSMD5Q16401 504 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 FAM196AQ6ZSG2 479 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 ILDR2Q71H61 639 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 TMC8Q8IU68 726 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 ATG4AQ8WYN0 398 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 TOR4AQ9NXH8 423 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 RAMP2O60895 175 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 CYP7B1O75881 506 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 PPP3R1P63098 170 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 CYP4F2P78329 520 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 MYBPC1Q00872 1141 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 CYP4F3Q08477 520 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 PROSER3Q2NL68 480 aa5.12□□□□□ -1.59
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SMG1-211ENST00000565324 SPATA19Q7Z5L4 167 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 OR2L5Q8NG80 312 aa5.12□□□□□ -1.59
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SMG1-211ENST00000565324 MTMR10Q9NXD2 777 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 ANKDD1BA6NHY2 528 aa5.12□□□□□ -1.59
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SMG1-211ENST00000565324 MID1O15344 667 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 PTPN5P54829 565 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 PKNOX1P55347 436 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 PPP2R2BQ00005 443 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 TTMPQ5BVD1 217 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 RTL4Q6ZR62 310 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 RNF44Q7L0R7 432 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 ABRAQ8N0Z2 381 aa5.12□□□□□ -1.59
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SMG1-211ENST00000565324 FATE1Q969F0 183 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 GAL3ST3Q96A11 431 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 CCSER2Q9H7U1 834 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 DPP7Q9UHL4 492 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 PLA2G4CQ9UP65 541 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 ZNF609O15014 1411 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 ERVK-7P63135 1459 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 GSG1L2A8MUP6 293 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 NUAK1O60285 661 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 SNX3O60493 162 aa5.12□□□□□ -1.59
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SMG1-211ENST00000565324 YES1P07947 543 aa5.12□□□□□ -1.59
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SMG1-211ENST00000565324 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 PLEKHG6Q3KR16 790 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 MPP5Q8N3R9 675 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 CD320Q9NPF0 282 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 IFT46Q9NQC8 304 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 OR2AT4A6NND4 320 aa5.12□□□□□ -1.59
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SMG1-211ENST00000565324 LTFP02788 710 aa5.12□□□□□ -1.59
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SMG1-211ENST00000565324 GCNT1Q02742 428 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 PTF1AQ7RTS3 328 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 ZZZ3Q8IYH5 903 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
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SMG1-211ENST00000565324 AP4B1Q9Y6B7 739 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 HDAC3O15379 428 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 MPZL3Q6UWV2 235 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 KBTBD4Q9NVX7 518 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 ARL15Q9NXU5 204 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 GULP1Q9UBP9 304 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 TRPS1Q9UHF7 1281 aa5.12□□□□□ -1.59
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SMG1-211ENST00000565324 E7ENX8 843 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 KRT33AO76009 404 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 C9P02748 559 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 THP07101 528 aa5.12□□□□□ -1.59
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SMG1-211ENST00000565324 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 TAMM41Q96BW9 452 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 SIPA1Q96FS4 1042 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 SLC4A5Q9BY07 1137 aa5.12□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa5.11□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 POU6F1Q14863 301 aa5.11□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 FBXO43Q4G163 708 aa5.11□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 FAM171BQ6P995 826 aa5.11□□□□□ -1.59
SMG1-211ENST00000565324 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
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