RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561438.5

TMOD3-211, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD3, Length 1,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-211ENST00000561438 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP8.42□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 PCYOX1Q9UHG3 505 aa8.42□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 SARDHQ9UL12 918 aa8.42□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa8.42□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 V9GYY5 206 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 ESYT3A0FGR9 886 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 ARHGAP42A6NI28 874 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 TERTO14746 1132 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 MCF2LO15068 1137 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 PIGNO95427 931 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 PRLP01236 227 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 MYBL2P10244 700 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 CCNB1P14635 433 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 ITIH2P19823 946 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 ECHS1P30084 290 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 SERPINB6P35237 376 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 GRIA2P42262 883 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 VPS41P49754 854 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 COPAP53621 1224 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 TERF1P54274 439 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 ECT2LQ008S8 904 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 SLC7A5Q01650 507 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 TRAF2Q12933 501 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 MTM1Q13496 603 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 PDK1Q15118 436 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 TMEM31Q5JXX7 168 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 C9orf64Q5T6V5 341 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 KCTD11Q693B1 232 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 KDELC1Q6UW63 502 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 CACUL1Q86Y37 369 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 JAMLQ86YT9 394 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 CCNYQ8ND76 341 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 OR2A12Q8NGT7 310 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 FAM3CQ92520 227 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 SLCO2A1Q92959 643 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 FATE1Q969F0 183 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 CCDC74AQ96AQ1 378 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 TEKT5Q96M29 485 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 AGAP3Q96P47 875 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 PSKH2Q96QS6 385 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 MGME1Q9BQP7 344 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 TBC1D17Q9HA65 648 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 SP110Q9HB58 689 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 NOD2Q9HC29 1040 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 TMEM51Q9NW97 253 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 GRHL1Q9NZI5 618 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 UBP1Q9NZI7 540 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 SERGEFQ9UGK8 458 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 FAM50BQ9Y247 325 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 STARD13Q9Y3M8 1113 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 C5orf60A6NFR6 353 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 EREGO14944 169 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 SIN3BO75182 1162 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 USP12O75317 370 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 BANF1O75531 89 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 GCATO75600 419 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 APODP05090 189 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 PRKCGP05129 697 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 DCNP07585 359 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 PDHA1P08559 390 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 DLDP09622 509 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 SOX18P35713 384 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 CHRNA4P43681 627 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 MMP13P45452 471 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 RPL21P46778 160 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 SEMG2Q02383 582 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 PLAURQ03405 335 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 SLC12A1Q13621 1099 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 SPARCL1Q14515 664 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 DLG2Q15700 870 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 TEX44Q53QW1 395 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 ODF2Q5BJF6 829 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 LRRC73Q5JTD7 316 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 CCDC181Q5TID7 509 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 ZDHHC24Q6UX98 284 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 STK40Q8N2I9 435 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 MMGT1Q8N4V1 131 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 PJA1Q8NG27 643 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 CPT1BQ92523 772 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-211ENST00000561438 SPATA13Q96N96 652 aa8.4□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms