RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559557.1

MRPS11-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein S11, human

TSL 3

Gene MRPS11, Length 447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPS11-208	ENST00000559557	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	CCDC96	Q2M329	555 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	FAM160B2	Q86V87	743 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	MORC4	Q8TE76	937 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	EVI5L	Q96CN4	794 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	FBXO40	Q9UH90	709 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	ARID2	Q68CP9	1835 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	TPP1	O14773	563 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	IGHD	P01880	384 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	MYOG	P15173	224 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	FOSL2	P15408	326 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	TNFRSF1B	P20333	461 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	HOXD12	P35452	270 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF543	Q08ER8	600 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	MTAP	Q13126	283 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	ITGA7	Q13683	1181 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	KCNJ12	Q14500	433 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	PTGR1	Q14914	329 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	SMC5	Q8IY18	1101 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	SELENON	Q9NZV5	590 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	DPPA5	A6NC42	116 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	EPOP	A6NHQ4	379 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	ASB14	A6NK59	587 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	EPN2	O95208	641 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	IDE	P14735	1019 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	CALML3	P27482	149 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	NDUFS1	P28331	727 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	ATIC	P31939	592 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	SLC8A1	P32418	973 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	CCL23	P55773	120 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	ZXDB	P98169	803 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	TCTN1	Q2MV58	587 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	USH1G	Q495M9	461 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF585B	Q52M93	769 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	FAXC	Q5TGI0	409 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	HERVK_113	Q902F9	699 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	TIFA	Q96CG3	184 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	HIPK3	Q9H422	1215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	EMSY	Q7Z589	1322 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557		A6NNZ2	444 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	NGFR	P08138	427 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	IDUA	P35475	653 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	PBX1	P40424	430 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	GSTM5	P46439	218 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS11-208	ENST00000559557	POLD2	P49005	469 aa		4.89	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms