RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	CKAP5	Q14008	2032 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	HHLA1	C9JL84	531 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	PMM2	O15305	246 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	CHAD	O15335	359 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	NCAM2	O15394	837 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	TEX33	O43247	280 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	COCH	O43405	550 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	BRINP1	O60477	761 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	TLR5	O60602	858 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	TSPAN3	O60637	253 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	GRAP2	O75791	330 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	PRAMEF12	O95522	483 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	ARSA	P15289	507 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	TNFAIP3	P21580	790 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	FCAR	P24071	287 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	CSF2RB	P32927	897 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	STAT1	P42224	750 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	PGF	P49763	221 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	RRAD	P55042	308 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	UBASH3A	P57075	661 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	SNX16	P57768	344 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	PHC1	P78364	1004 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	GCNT1	Q02742	428 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	ADCY2	Q08462	1091 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	RUNX3	Q13761	415 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	MTF1	Q14872	753 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	MYBPC3	Q14896	1274 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	PMF1	Q6P1K2	205 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	ERICH1	Q86X53	443 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	CPA6	Q8N4T0	437 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	ATL2	Q8NHH9	583 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	STK33	Q9BYT3	514 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	NMUR1	Q9HB89	426 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	SIX2	Q9NPC8	291 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	SCML2	Q9UQR0	700 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	INVS	Q9Y283	1065 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	CEP83	Q9Y592	693 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATXN3-238	ENST00000556288	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		4.84	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		4.84	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TTC28	Q96AY4	2481 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TRIO	O75962	3097 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288		E7ENQ6	273 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288		O00370	1275 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ULK1	O75385	1050 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	SETSIP	P0DME0	302 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	UCHL3	P15374	230 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF18	P17022	549 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ETV4	P43268	484 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ACADSB	P45954	432 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	MEOX1	P50221	254 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CLCN5	P51795	746 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	COG7	P83436	770 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	STAT4	Q14765	748 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	IQCB1	Q15051	598 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	PDGFRL	Q15198	375 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	SCD5	Q86SK9	330 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	RASSF3	Q86WH2	238 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	DENND1C	Q8IV53	801 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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