RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550233.1

TMEM116-211, Transcript of transmembrane protein 116, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene TMEM116, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM116-211ENST00000550233 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 TRAV34A0A0B4J273 112 aa4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 ARHGEF37A1IGU5 675 aa4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 TMEM200CA6NKL6 621 aa4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 C19orf81C9J6K1 198 aa4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 EBAG9O00559 213 aa4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 USP12O75317 370 aa4.96□□□□□ -1.62
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TMEM116-211ENST00000550233 CHRM2P08172 466 aa4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 APEHP13798 732 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 AKR1A1P14550 325 aa4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 CASTP20810 708 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 CD72P21854 359 aa4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 EPHB2P29323 1055 aa4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP4.96□□□□□ -1.621e-8■□□□□ 9.6
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TMEM116-211ENST00000550233 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
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TMEM116-211ENST00000550233 FAM189BP81408 668 aa4.96□□□□□ -1.62
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TMEM116-211ENST00000550233 RUNX2Q13950 521 aa4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 KCNC3Q14003 757 aa4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 MFSD13AQ14CX5 517 aa4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 HYAL4Q2M3T9 481 aa4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 VMACQ2NL98 169 aa4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 TYSND1Q2T9J0 566 aa4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 ALG11Q2TAA5 492 aa4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa4.96□□□□□ -1.62
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TMEM116-211ENST00000550233 TRAT1Q6PIZ9 186 aa4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 CNSTQ6PJW8 725 aa4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 Q6ZSN1 163 aa4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 UEVLDQ8IX04 471 aa4.96□□□□□ -1.62
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TMEM116-211ENST00000550233 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 TRIML1Q8N9V2 468 aa4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 HDAC7Q8WUI4 952 aa4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 PTP4A1Q93096 173 aa4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 SNX21Q969T3 373 aa4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 EXOC4Q96A65 974 aa4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 PTERQ96BW5 349 aa4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 ELMOD3Q96FG2 381 aa4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 P2RY11Q96G91 374 aa4.96□□□□□ -1.62
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TMEM116-211ENST00000550233 PAFAH2Q99487 392 aa4.96□□□□□ -1.62
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TMEM116-211ENST00000550233 MMP27Q9H306 513 aa4.96□□□□□ -1.62
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TMEM116-211ENST00000550233 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 DLL3Q9NYJ7 618 aa4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 COPG2Q9UBF2 871 aa4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 DKK2Q9UBU2 259 aa4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 MOSPD1Q9UJG1 213 aa4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa4.95□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa4.95□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.95□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
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TMEM116-211ENST00000550233 HIST1H2ABP04908 130 aa4.95□□□□□ -1.62
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TMEM116-211ENST00000550233 C1QTNF9P0C862 333 aa4.95□□□□□ -1.62
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TMEM116-211ENST00000550233 ENGP17813 658 aa4.95□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 HIST1H2ADP20671 130 aa4.95□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 CHRNA5P30532 468 aa4.95□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 BPIFB3P59826 476 aa4.95□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 AP1B1Q10567 949 aa4.95□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 IL11RAQ14626 422 aa4.95□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 KCNB1Q14721 858 aa4.95□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 TXNRD1Q16881 649 aa4.95□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 USP41Q3LFD5 358 aa4.95□□□□□ -1.62
TMEM116-211ENST00000550233 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
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