RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548391.1

PRAMENP-203, Transcript of PRAME N-terminal-like, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene PRAMENP, Length 1,445 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMENP-203ENST00000548391 H3BRJ5 948 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 SCAMP1O15126 338 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 CYP1A2P05177 515 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 RARAP10276 462 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 JUPP14923 745 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 XPAP23025 273 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 AMPD1P23109 780 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 CASP14P31944 242 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 IGFALSP35858 605 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP11.93□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 ELP6Q0PNE2 266 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 HS1BP3Q53T59 392 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 HES3Q5TGS1 186 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 BRAT1Q6PJG6 821 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 SRLQ86TD4 932 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 ZSWIM9Q86XI8 627 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 TEKT4Q8WW24 435 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 RFFLQ8WZ73 363 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 HSPH1Q92598 858 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 BTBD6Q96KE9 485 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 NUP85Q9BW27 656 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 PCDH12Q9NPG4 1184 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP11.93□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 ETNK2Q9NVF9 386 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 NLGN3Q9NZ94 848 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 IP6K2Q9UHH9 426 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 ANAPC7Q9UJX3 599 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 LRRK1Q38SD2 2015 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 URB1O60287 2271 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 H3BM21 787 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 K7ESM1 405 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 MUSKO15146 869 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 NEBLO76041 1014 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 CKMT1AP12532 417 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 JUNDP17535 347 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 HNF1BP35680 557 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 ARL4AP40617 200 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 YPEL5P62699 121 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 CYP4F3Q08477 520 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 NFKBIBQ15653 356 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 CFAP58Q5T655 872 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 FAM181AQ8N9Y4 354 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 ECHDC3Q96DC8 303 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 APOLD1Q96LR9 279 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 NSMCE3Q96MG7 304 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 CSPG4P5Q96PW8 444 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 PSKH2Q96QS6 385 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 DUSP23Q9BVJ7 150 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 NENFQ9UMX5 172 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 U3KQA8 63 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 ANKRD36A6QL64 1941 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 MYLKQ15746 1914 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 MYO1FO00160 1098 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 TOR1BO14657 336 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 PEX11BO96011 259 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 ALPPL2P10696 532 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 C6P13671 934 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 SERPINA4P29622 427 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 MMP12P39900 470 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 DAB2P98082 770 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 E2F1Q01094 437 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 SLC10A7Q0GE19 358 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP11.91□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 PTK2BQ14289 1009 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 LBRQ14739 615 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 IRF4Q15306 451 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 WSCD2Q2TBF2 565 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 CCDC122Q5T0U0 273 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 TMCO4Q5TGY1 634 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 ERAP2Q6P179 960 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 TMCO3Q6UWJ1 677 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 ZNF599Q96NL3 588 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 PCDH18Q9HCL0 1135 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 SEPT3Q9UH03 358 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 COQ6Q9Y2Z9 468 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP11.91□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAMENP-203ENST00000548391 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms