RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 SLC39A8Q9C0K1 460 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 MLXIPLQ9NP71 852 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 NDFIP2Q9NV92 336 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 PLK2Q9NYY3 685 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP7.87□□□□□ -1.152e-10■■■□□ 15.1
CS-204ENST00000546621 MPP6Q9NZW5 540 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 USH1CQ9Y6N9 552 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 SHROOM3Q8TF72 1996 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 NUP205Q92621 2012 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 ARHGAP10A1A4S6 786 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 MATN3O15232 486 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 TYROBPO43914 113 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 CACNG3O60359 315 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 TLR5O60602 858 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 MAFKO60675 156 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 EFCAB14O75071 495 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 BAIAP3O94812 1187 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 TIMP1P01033 207 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 MT-ND3P03897 115 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 RHOQP17081 205 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 PGAM1P18669 254 aa7.86□□□□□ -1.15
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CS-204ENST00000546621 HMOX2P30519 316 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 ETV3P41162 512 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 DEFB103AP81534 67 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 DSG1Q02413 1049 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 SPARCL1Q14515 664 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 PRPSAP1Q14558 356 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 NR1D2Q14995 579 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 CCDC6Q16204 474 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 WDR45BQ5MNZ6 344 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 CASC4Q6P4E1 433 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 TTC23LQ6PF05 361 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 LVRNQ6Q4G3 990 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 THSD4Q6ZMP0 1018 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 CYS1Q717R9 158 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 MIB1Q86YT6 1006 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 CTAGE3PQ8IX95 158 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 SLC39A11Q8N1S5 342 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 PPM1NQ8N819 430 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 PDZD8Q8NEN9 1154 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 OR52K1Q8NGK4 314 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 ARNTL2Q8WYA1 636 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 OVCA2Q8WZ82 227 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 SDCCAG3Q96C92 435 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 TMEM169Q96HH4 297 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 BIRC8Q96P09 236 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 CLSTN3Q9BQT9 956 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 ZYG11BQ9C0D3 744 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 MCOLN1Q9GZU1 580 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 CCSER2Q9H7U1 834 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 C12orf10Q9HB07 376 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 PLGRKTQ9HBL7 147 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 SMYD2Q9NRG4 433 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 TMEM248Q9NWD8 314 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 VANGL2Q9ULK5 521 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 DMTF1Q9Y222 760 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 NOX1Q9Y5S8 564 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 CARNS1A5YM72 827 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 KIAA0355O15063 1070 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 PSMD3O43242 534 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 ALDH1A2O94788 518 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 ABLIM3O94929 683 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 CSH1P0DML2 217 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 CSH2P0DML3 217 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 CSF2RAP15509 400 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 GM2AP17900 193 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 LAG3P18627 525 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 CA4P22748 312 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 ITGB8P26012 769 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
CS-204ENST00000546621 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
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