RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544662.1

PUS1-211, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene PUS1, Length 836 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-211ENST00000544662 CDC25BP30305 580 aa22.06■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 MMP13P45452 471 aa22.06■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 SHBQ15464 509 aa22.06■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 TMEM52BQ4KMG9 183 aa22.06■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 MARC1Q5VT66 337 aa22.06■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa22.06■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 RHOT1Q8IXI2 618 aa22.06■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 BBS5Q8N3I7 341 aa22.06■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 OR13H1Q8NG92 308 aa22.06■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 CXorf40AQ8TE69 158 aa22.06■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 ASB12Q8WXK4 309 aa22.06■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 PCDH12Q9NPG4 1184 aa22.06■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 BTBD3Q9Y2F9 522 aa22.06■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa22.06■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 A6NNZ2 444 aa22.05■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 ZNF487B1APH4 448 aa22.05■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 CR2P20023 1033 aa22.05■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 GBE1Q04446 702 aa22.05■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 ELP6Q0PNE2 266 aa22.05■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 RAD9BQ6WBX8 426 aa22.05■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 RHBDD1Q8TEB9 315 aa22.05■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 ECHDC3Q96DC8 303 aa22.05■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 BMFQ96LC9 184 aa22.05■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 NUDCD1Q96RS6 583 aa22.05■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 MGME1Q9BQP7 344 aa22.05■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 LRRK1Q38SD2 2015 aa22.04■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 YKT6O15498 198 aa22.04■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 PRKCGP05129 697 aa22.04■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 PMLP29590 882 aa22.04■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 MAXP61244 160 aa22.04■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 ERAP2Q6P179 960 aa22.04■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 VSIG1Q86XK7 387 aa22.04■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 GATAD2AQ86YP4 633 aa22.04■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 OXR1Q8N573 874 aa22.04■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 TEX26Q8N6G2 289 aa22.04■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 PAF1Q8N7H5 531 aa22.04■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 SPC24Q8NBT2 197 aa22.04■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 TSGA13Q96PP4 275 aa22.04■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 GOLPH3Q9H4A6 298 aa22.04■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 SCUBE2Q9NQ36 999 aa22.04■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa22.04■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 ALG6Q9Y672 507 aa22.04■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 NCOR2Q9Y618 2525 aa22.04■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 RCCD1A6NED2 376 aa22.03■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 POM121BA6NF01 834 aa22.03■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 FPGTO14772 594 aa22.03■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 MATN3O15232 486 aa22.03■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 TM7SF2O76062 418 aa22.03■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 CCNCP24863 283 aa22.03■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 RXRGP48443 463 aa22.03■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 SEMG2Q02383 582 aa22.03■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 Q6ZSR6 202 aa22.03■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 PLD5Q8N7P1 536 aa22.03■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 DENND6BQ8NEG7 585 aa22.03■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 FAM174AQ8TBP5 190 aa22.03■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 SAP25Q8TEE9 199 aa22.03■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 LRRN4Q8WUT4 740 aa22.03■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 MAML1Q92585 1016 aa22.03■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 NOD2Q9HC29 1040 aa22.03■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 NT5MQ9NPB1 228 aa22.03■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 DTLQ9NZJ0 730 aa22.03■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 IMPACTQ9P2X3 320 aa22.03■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa22.03■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 ITGAVP06756 1048 aa22.02■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 MX2P20592 715 aa22.02■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 MMP12P39900 470 aa22.02■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 GRK6P43250 576 aa22.02■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 BNIP3Q12983 259 aa22.02■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 ODF2Q5BJF6 829 aa22.02■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 RALGPS1Q5JS13 557 aa22.02■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 SLC9A4Q6AI14 798 aa22.02■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 C11orf63Q6NUN7 778 aa22.02■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa22.02■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 FATE1Q969F0 183 aa22.02■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 CENPTQ96BT3 561 aa22.02■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PUS1-211ENST00000544662 SALL4Q9UJQ4 1053 aa22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms