RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540606.5

ATE1-208, Transcript of arginyltransferase 1, human

TSL 2 BASIC

Gene ATE1, Length 5,165 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATE1-208	ENST00000540606	B4GALT4	O60513	344 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	HLA-DQA2	P01906	255 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	ITGAV	P06756	1048 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	EPHA3	P29320	983 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	UBE2E3	Q969T4	207 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	LRRC19	Q9H756	370 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	TMEM51	Q9NW97	253 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	OPLAH	O14841	1288 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	CDK14	O94921	469 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	ADH1C	P00326	375 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	FTH1	P02794	183 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	ALAD	P13716	330 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	MMP8	P22894	467 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	SLC5A3	P53794	718 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	NRF1	Q16656	503 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	MAML3	Q96JK9	1138 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	REEP1	Q9H902	201 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	ANXA6	P08133	673 aa		13.33	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	SMPD1	P17405	629 aa		13.33	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	LAG3	P18627	525 aa		13.33	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		13.33	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	CEP68	Q76N32	757 aa		13.33	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		13.33	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		13.33	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	13.33	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		13.33	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	ADI1	Q9BV57	179 aa		13.33	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		13.33	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	NMUR1	Q9HB89	426 aa		13.33	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		13.33	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	VWA7	Q9Y334	891 aa		13.33	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	TRIM32	Q13049	653 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	DGCR6	Q14129	220 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	IQCF5	A8MTL0	148 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	ACSL4	O60488	711 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	EPHX1	P07099	455 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	RABGGTB	P53611	331 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	STX4	Q12846	297 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	TEKT5	Q96M29	485 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	EXO5	Q9H790	373 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	KPNA5	O15131	536 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	GRIA3	P42263	894 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	VSTM1	Q6UX27	236 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	DEPDC5	O75140	1603 aa		13.32	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	FGF1	P05230	155 aa		13.32	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	INA	Q16352	499 aa		13.32	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		13.32	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		13.32	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		13.32	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	GLOD4	Q9HC38	313 aa		13.32	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	FSCN2	O14926	492 aa		13.32	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	SCAMP1	O15126	338 aa		13.32	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	CLDN11	O75508	207 aa		13.32	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	KCNH1	O95259	989 aa		13.32	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	MYBL2	P10244	700 aa		13.32	□□□□□ -0.28
ATE1-208	ENST00000540606	NR2F1	P10589	423 aa		13.32	□□□□□ -0.28

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms