RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 CD86P42081 329 aa20.44■□□□□ 0.86
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PACSIN3-211ENST00000539589 GPM6BQ13491 265 aa20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
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PACSIN3-211ENST00000539589 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
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PACSIN3-211ENST00000539589 ELMOD1Q8N336 334 aa20.44■□□□□ 0.86
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PACSIN3-211ENST00000539589 ATP13A1Q9HD20 1204 aa20.44■□□□□ 0.86
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PACSIN3-211ENST00000539589 MOSPD3O75425 235 aa20.43■□□□□ 0.86
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PACSIN3-211ENST00000539589 PTPN4P29074 926 aa20.43■□□□□ 0.86
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PACSIN3-211ENST00000539589 ACVRL1P37023 503 aa20.43■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 NUMBP49757 651 aa20.43■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 USP10Q14694 798 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
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PACSIN3-211ENST00000539589 SLC25A41Q8N5S1 370 aa20.43■□□□□ 0.86
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PACSIN3-211ENST00000539589 NMRAL1Q9HBL8 299 aa20.43■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 NOD2Q9HC29 1040 aa20.43■□□□□ 0.86
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PACSIN3-211ENST00000539589 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa20.43■□□□□ 0.86
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PACSIN3-211ENST00000539589 CDC25CP30307 473 aa20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 CSRP3P50461 194 aa20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 EPHA5P54756 1037 aa20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC7A9P82251 487 aa20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 DSC2Q02487 901 aa20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 CTBP1Q13363 440 aa20.42■□□□□ 0.86
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PACSIN3-211ENST00000539589 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
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PACSIN3-211ENST00000539589 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.86
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PACSIN3-211ENST00000539589 MAGEC3Q8TD91 643 aa20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 SAMD11Q96NU1 681 aa20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 PBX4Q9BYU1 374 aa20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 RETREG1Q9H6L5 497 aa20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 ARL8BQ9NVJ2 186 aa20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 MYOFQ9NZM1 2061 aa20.42■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A0D9SEW6 157 aa20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 GFRA2O00451 464 aa20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 MMP2P08253 660 aa20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 SAT1P21673 171 aa20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 CDH4P55283 916 aa20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 ITGA9Q13797 1035 aa20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa20.41■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 NMUR2Q9GZQ4 415 aa20.41■□□□□ 0.86
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