RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 TBCDQ9BTW9 1192 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 SIK3Q9Y2K2 1263 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 PIPSLA2A3N6 862 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 ANKRD65E5RJM6 399 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 FFAR3O14843 346 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 GPR42O15529 346 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 FFAR2O15552 330 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 MAN1A2O60476 641 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 ETS1P14921 441 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 BLKP51451 505 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 CLCN5P51795 746 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 TRIM32Q13049 653 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 PTPRNQ16849 979 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 MACC1Q6ZN28 852 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 NETO2Q8NC67 525 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 EPS8L1Q8TE68 723 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 BADQ92934 168 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 RNF157Q96PX1 679 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 COL20A1Q9P218 1284 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 NDUFAF1Q9Y375 327 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 KCNH1O95259 989 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 LYPLA2O95372 231 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 CCDC166P0CW27 439 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 ABCG1P45844 678 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 GRB14Q14449 540 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 TRIP10Q15642 601 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 LGMNQ99538 433 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 HSD17B14Q9BPX1 270 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 ABCB8Q9NUT2 735 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 CHKBQ9Y259 395 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 RAI2Q9Y5P3 530 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 SLC28A1O00337 649 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 APOA1P02647 267 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 WARSP23381 471 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 CMPK1P30085 196 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 IGFALSP35858 605 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 GNPDA1P46926 289 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM63BQ5T3F8 832 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM164Q5U3C3 297 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 SHC3Q92529 594 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 PCED1BQ96HM7 432 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 ACAT2Q9BWD1 397 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 IL36AQ9UHA7 158 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRB-204ENST00000538708 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 ERCC2P18074 760 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 TARSP26639 723 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 SPAM1P38567 509 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 CXCR3P49682 368 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 CLK1P49759 484 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 NCF4Q15080 339 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 PHF19Q5T6S3 580 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 PRMT9Q6P2P2 845 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 LEMD2Q8NC56 503 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 LINGO1Q96FE5 620 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 DUSP12Q9UNI6 340 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 COQ6Q9Y2Z9 468 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 PRKAB1Q9Y478 270 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 A0A1W2PQ67 120 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 POP4O95707 220 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 RABGGTBP53611 331 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 STX4Q12846 297 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 GRM2Q14416 872 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 E2F4Q16254 413 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 IL17AQ16552 155 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 EPHX4Q8IUS5 362 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF563Q8TA94 476 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 C12orf42Q96LP6 360 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 CNBD2Q96M20 576 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 SAMD11Q96NU1 681 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 OLFM3Q96PB7 478 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 KCNS3Q9BQ31 491 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 B3GNT5Q9BYG0 378 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 ROBO3Q96MS0 1386 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 LTBP3Q9NS15 1303 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 SERPINE1P05121 402 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 FOSL2P15408 326 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 MASP1P48740 699 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 FNBP1LQ5T0N5 605 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 SNX30Q5VWJ9 437 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 BHLHB9Q6PI77 547 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF398Q8TD17 642 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 AP2M1Q96CW1 435 aa9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms