RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531691.5

TXNRD1-223, Transcript of thioredoxin reductase 1, human

TSL 2

Gene TXNRD1, Length 728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TXNRD1-223	ENST00000531691	NKX2-8	O15522	239 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	THAP12	O43422	761 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	GRAP2	O75791	330 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZMPSTE24	O75844	475 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	F9	P00740	461 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	UGT2B4	P06133	528 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	11.29	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	RAD51	Q06609	339 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	11.29	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	IRF4	Q15306	451 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	MYLK3	Q32MK0	819 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	AMZ1	Q400G9	498 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	EFHC2	Q5JST6	749 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	WDR92	Q96MX6	357 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	APOO	Q9BUR5	198 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	DDA1	Q9BW61	102 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	MPP6	Q9NZW5	540 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	RAD1	O60671	282 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	SRGAP2	O75044	1071 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	GSR	P00390	522 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRT7	P08729	469 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	PRKAR1A	P10644	381 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	ALDH4A1	P30038	563 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	GNA15	P30679	374 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	GK	P32189	559 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	CXCR3	P49682	368 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	SUOX	P51687	545 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	GNA12	Q03113	381 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	BIRC2	Q13490	618 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	11.28	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	INPP5A	Q14642	412 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	SYNC	Q9H7C4	482 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	RDH14	Q9HBH5	336 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	PIGV	Q9NUD9	493 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	RMND1	Q9NWS8	449 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	HPSE	Q9Y251	543 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TXNRD1-223	ENST00000531691	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TXNRD1-223	ENST00000531691	EFCAB7	A8K855	629 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TXNRD1-223	ENST00000531691		B4DGG1	531 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TXNRD1-223	ENST00000531691	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TXNRD1-223	ENST00000531691	B4GAT1	O43505	415 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TXNRD1-223	ENST00000531691	DAB1	O75553	588 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TXNRD1-223	ENST00000531691	F13A1	P00488	732 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TXNRD1-223	ENST00000531691	TIMP2	P16035	220 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TXNRD1-223	ENST00000531691	KEL	P23276	732 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TXNRD1-223	ENST00000531691	MAN1A1	P33908	653 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TXNRD1-223	ENST00000531691	MLLT10	P55197	1068 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TXNRD1-223	ENST00000531691	RAB15	P59190	212 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TXNRD1-223	ENST00000531691	ARF5	P84085	180 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TXNRD1-223	ENST00000531691	B4GALNT1	Q00973	533 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TXNRD1-223	ENST00000531691	ELP6	Q0PNE2	266 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TXNRD1-223	ENST00000531691	CDC20	Q12834	499 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TXNRD1-223	ENST00000531691	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TXNRD1-223	ENST00000531691	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TXNRD1-223	ENST00000531691	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TXNRD1-223	ENST00000531691	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TXNRD1-223	ENST00000531691	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TXNRD1-223	ENST00000531691	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TXNRD1-223	ENST00000531691	ART4	Q93070	314 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TXNRD1-223	ENST00000531691	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TXNRD1-223	ENST00000531691	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TXNRD1-223	ENST00000531691	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TXNRD1-223	ENST00000531691	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TXNRD1-223	ENST00000531691	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61

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