RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 STYXL1Q9Y6J8 313 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 MYH11P35749 1972 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 LACTBL1A8MY62 500 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 H3BQV1 296 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 PIRO00625 290 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF185O15231 689 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 TBCAO75347 108 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 IL18RAPO95256 599 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 MYL4P12829 197 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 TYRP14679 529 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 TGM1P22735 817 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 UBA7P41226 1012 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 PNPLA4P41247 253 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 TNFSF9P41273 254 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 VIPR2P41587 438 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 CXCL12P48061 93 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 MCM2P49736 904 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM132DQ14C87 1099 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 PTPAQ15257 358 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 CCDC157Q569K6 752 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 C9orf57Q5W0N0 161 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 DBX2Q6ZNG2 339 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 LONP2Q86WA8 852 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 GPBP1Q86WP2 473 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 YAF2Q8IY57 180 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF276Q8N554 614 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 DCLK2Q8N568 766 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 AOPEPQ8N6M6 819 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 OR56A1Q8NGH5 318 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 SPATA18Q8TC71 538 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 SPPL2BQ8TCT7 592 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 SENP8Q96LD8 212 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 FIZ1Q96SL8 496 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 KIF9Q9HAQ2 790 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 LMAN1LQ9HAT1 526 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 KLHL11Q9NVR0 708 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 SEL1LQ9UBV2 794 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 ZZEF1O43149 2961 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 CDHR4A6H8M9 788 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 MATN3O15232 486 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 AKAP3O75969 853 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 CCNE1P24864 410 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 TAF6P49848 677 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 TUBA3CQ13748 450 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 POSTNQ15063 836 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 GFOD2Q3B7J2 385 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 SLC39A12Q504Y0 691 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 JADE1Q6IE81 842 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 SLC39A4Q6P5W5 647 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 TUBA3EQ6PEY2 450 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 TSSK4Q6SA08 328 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 METTL23Q86XA0 190 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 FAM90A1Q86YD7 464 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 THEM5Q8N1Q8 247 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 MYCT1Q8N699 235 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 TBC1D15Q8TC07 691 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 RAD54LQ92698 747 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 EXOC4Q96A65 974 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 RSPRY1Q96DX4 576 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 CEP295NLQ96MC4 621 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF560Q96MR9 790 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 VPS11Q9H270 941 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 TASP1Q9H6P5 420 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 PNPOQ9NVS9 261 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 RLIMQ9NVW2 624 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4D-222ENST00000514552 SLC38A8A6NNN8 435 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 SLC30A4O14863 429 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 ATG13O75143 517 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 UBXN7O94888 489 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 PRSS23O95084 383 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 PRAMEF12O95522 483 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 OR4Q2P0C623 313 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 GJA1P17302 382 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 ATF6P18850 670 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 TNFRSF1AP19438 455 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 GABRR2P28476 465 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 GJB2P29033 226 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 PIK3CGP48736 1102 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 LIMK1P53667 647 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 DGCR2P98153 550 aa7.21□□□□□ -1.26
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