RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PIGNO95427 931 aa15.28■□□□□ 0.04
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM228BP0C875 321 aa15.28■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CKMT1AP12532 417 aa15.28■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IL1R2P27930 398 aa15.28■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SERPINA4P29622 427 aa15.28■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 CAMK1DQ8IU85 385 aa15.28■□□□□ 0.04
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 CFAP69A5D8W1 941 aa15.27■□□□□ 0.04
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 K7ESM1 405 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TPP1O14773 563 aa15.27■□□□□ 0.04
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 AP1S1P61966 158 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BCL2L1Q07817 233 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CYP4F3Q08477 520 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LRRC14Q15048 493 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AGERQ15109 404 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCDC122Q5T0U0 273 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HES3Q5TGS1 186 aa15.27■□□□□ 0.04
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MDM1Q8TC05 714 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HSPH1Q92598 858 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TBATAQ96M53 351 aa15.27■□□□□ 0.04
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP15.27■□□□□ 0.04
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LBRQ14739 615 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HADHQ16836 314 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SMTNL2Q2TAL5 461 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 BBS5Q8N3I7 341 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PAF1Q8N7H5 531 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ECHDC3Q96DC8 303 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NXPE2Q96DL1 559 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 APOLD1Q96LR9 279 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CSPG4P5Q96PW8 444 aa15.26■□□□□ 0.03
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LCMT1Q9UIC8 334 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SALL4Q9UJQ4 1053 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 CBFA2T2O43439 604 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C6P13671 934 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CASP14P31944 242 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SERPINB6P35237 376 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MMP12P39900 470 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LIG3P49916 1009 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SCNN1BP51168 640 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BLKP51451 505 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 WSCD2Q2TBF2 565 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TPRG1LQ5T0D9 272 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MACC1Q6ZN28 852 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NSMCE1Q8WV22 266 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPOCK2Q92563 424 aa15.25■□□□□ 0.03
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