RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504263.1

PCAT4-201, prostate cancer associated transcript 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCAT4, Length 2,091 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCAT4-201ENST00000504263 HTR3AP46098 478 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 NPTX2P47972 431 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 RAD23AP54725 363 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 AQP5P55064 265 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 CDH15P55291 814 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 ERVK-21P61565 698 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 VBP1P61758 197 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 FOXO4P98177 505 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 MPP1Q00013 466 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 TSPY1Q01534 308 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 INCA1Q0VD86 236 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 KCNH2Q12809 1159 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 DNASE1L3Q13609 305 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 FLOT2Q14254 428 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 PPP2R5DQ14738 602 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 GRIN2CQ14957 1233 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 NFIL3Q16649 462 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 DGUOKQ16854 277 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 SLC36A3Q495N2 470 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 TOR2AQ5JU69 321 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 NKAPLQ5M9Q1 402 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 FAXCQ5TGI0 409 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 CST9Q5W186 159 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 TIGD3Q6B0B8 471 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 RINT1Q6NUQ1 792 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 DCUN1D2Q6PH85 259 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 ARSKQ6UWY0 536 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 LMBR1LQ6UX01 489 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 KCTD8Q6ZWB6 473 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 SV2BQ7L1I2 683 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 ATG9AQ7Z3C6 839 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF438Q7Z4V0 828 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 BTLAQ7Z6A9 289 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 DPP9Q86TI2 863 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 NKAIN4Q8IVV8 208 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 CTAGE3PQ8IX95 158 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 CPNE9Q8IYJ1 553 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 UBQLNLQ8IYU4 475 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 SCML4Q8N228 414 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 CADM2Q8N3J6 435 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 CCNYL1Q8N7R7 359 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 FAM47BQ8NA70 645 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 LEMD2Q8NC56 503 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 ETNPPLQ8TBG4 499 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 ZFAND1Q8TCF1 268 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 SEPT8Q92599 483 aa3.55□□□□□ -1.84
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PCAT4-201ENST00000504263 POM121Q96HA1 1249 aa3.55□□□□□ -1.84
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PCAT4-201ENST00000504263 C9orf72Q96LT7 481 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 GLT1D1Q96MS3 346 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 TSNARE1Q96NA8 513 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 TTPALQ9BTX7 342 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 BTBD2Q9BX70 525 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 ANO3Q9BYT9 981 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 COA1Q9GZY4 146 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 LHX5Q9H2C1 402 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 SLC6A15Q9H2J7 730 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 PPA2Q9H2U2 334 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 COQ10BQ9H8M1 238 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 EFCAB1Q9HAE3 211 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 SIX2Q9NPC8 291 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 FAM105AQ9NUU6 356 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 GGA3Q9NZ52 723 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 GLTPQ9NZD2 209 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 ACTR3BQ9P1U1 418 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 MTRRQ9UBK8 725 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 FAM8A1Q9UBU6 413 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 GLS2Q9UI32 602 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 FBXO5Q9UKT4 447 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 SHOC2Q9UQ13 582 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 DTX4Q9Y2E6 619 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 RAD54BQ9Y620 910 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 AKAP11Q9UKA4 1901 aa3.54□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 ROBO3Q96MS0 1386 aa3.54□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 A0A0X1KG70 313 aa3.54□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 EFCAB10A6NFE3 127 aa3.54□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 HMX3A6NHT5 357 aa3.54□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 E5RJQ4 531 aa3.54□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 E7ESA3 106 aa3.54□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa3.54□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 M0R2N6 131 aa3.54□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 OIP5O43482 229 aa3.54□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 TOM1L1O75674 476 aa3.54□□□□□ -1.84
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