RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503668.1

HULC-201, hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HULC, Length 556 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HULC-201ENST00000503668 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 SNX27Q96L92 541 aa9.48□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 GCNAQ96QF7 691 aa9.48□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 MMP19Q99542 508 aa9.48□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 SLC25A23Q9BV35 468 aa9.48□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa9.48□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 DUSP16Q9BY84 665 aa9.48□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 VTA1Q9NP79 307 aa9.48□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 SNTG2Q9NY99 539 aa9.48□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 SLC8A2Q9UPR5 921 aa9.48□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 AP4S1Q9Y587 144 aa9.48□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 SNX9Q9Y5X1 595 aa9.48□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 PSAT1Q9Y617 370 aa9.48□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 EVPLQ92817 2033 aa9.48□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 PTPRFP10586 1907 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 A0A087WXM4 84 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 A0A087WZ62 844 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 HEATR9A2RTY3 570 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 AQP12BA6NM10 295 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 TARM1B6A8C7 271 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 FZD9O00144 591 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 PIRO00625 290 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 MFSD11O43934 449 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 TRMUO75648 421 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 PIGNO95427 931 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 H6PDO95479 791 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 FAM200BP0CF97 657 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 FCGR1AP12314 374 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 KCNE1P15382 129 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 PTPN3P26045 913 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 ADORA2AP29274 412 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 MLH1P40692 756 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 GRIA2P42262 883 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 GRIA4P48058 902 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 THOP1P52888 689 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 CCNA1P78396 465 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 HPCAP84074 193 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 GALNT2Q10471 571 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 SEMA3BQ13214 749 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 ORC1Q13415 861 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 PTK2BQ14289 1009 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 SOWAHAQ2M3V2 549 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 NADK2Q4G0N4 442 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 XKR4Q5GH76 650 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 COQ5Q5HYK3 327 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 PPM1JQ5JR12 505 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 FBXO47Q5MNV8 452 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 SYCP2LQ5T4T6 812 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 NOTUMQ6P988 496 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 FBXL19Q6PCT2 694 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 ALKAL1Q6UXT8 129 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 ERO1BQ86YB8 467 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 AQP12AQ8IXF9 295 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 DEFB106AQ8N104 65 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 CCDC185Q8N715 623 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 ANKFN1Q8N957 763 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 MFSD2AQ8NA29 543 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 TSPAN14Q8NG11 270 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 PPTC7Q8NI37 304 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 TEKT5Q96M29 485 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 AGAP3Q96P47 875 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 OR52B2Q96RD2 323 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 LGMNQ99538 433 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 RNPEPQ9H4A4 650 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 TASP1Q9H6P5 420 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 CD320Q9NPF0 282 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 CNGB3Q9NQW8 809 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 ARMC1Q9NVT9 282 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 AKT3Q9Y243 479 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 MYRFQ9Y2G1 1151 aa9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
HULC-201ENST00000503668 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa9.46□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 TCAF2A6NFQ2 919 aa9.46□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 HUS1O60921 280 aa9.46□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 ARIH2O95376 493 aa9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.7 ms