RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-241	ENST00000496183	TNFRSF8	P28908	595 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-241	ENST00000496183	CHKA	P35790	457 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-241	ENST00000496183	GJC1	P36383	396 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-241	ENST00000496183	DPP6	P42658	865 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-241	ENST00000496183	DSCR9	P59020	149 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-241	ENST00000496183	ACTR2	P61160	394 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-241	ENST00000496183	ARHGAP8	P85298	464 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-241	ENST00000496183	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-241	ENST00000496183	LRRC24	Q50LG9	513 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-241	ENST00000496183	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-241	ENST00000496183	DCAF6	Q58WW2	860 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-241	ENST00000496183	CCDC174	Q6PII3	467 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-241	ENST00000496183		Q6ZSV7	163 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-241	ENST00000496183	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-241	ENST00000496183	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-241	ENST00000496183	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-241	ENST00000496183	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-241	ENST00000496183	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-241	ENST00000496183	CCT6B	Q92526	530 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-241	ENST00000496183	OTULIN	Q96BN8	352 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-241	ENST00000496183	APOLD1	Q96LR9	279 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-241	ENST00000496183	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-241	ENST00000496183	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-241	ENST00000496183	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-241	ENST00000496183	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-241	ENST00000496183	ICK	Q9UPZ9	632 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-241	ENST00000496183	DERA	Q9Y315	318 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-241	ENST00000496183	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-241	ENST00000496183	DENND3	A2RUS2	1198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	ANP32C	O43423	234 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	ITM2A	O43736	263 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	CYP21A2	P08686	494 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	LYL1	P12980	280 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	ADD2	P35612	726 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	AMT	P48728	403 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	ART1	P52961	327 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	MVD	P53602	400 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	PRKAA2	P54646	552 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	GAS1	P54826	345 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	TRAF1	Q13077	416 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	PLCB4	Q15147	1175 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	FJX1	Q86VR8	437 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	GHDC	Q8N2G8	530 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	CHODL	Q9H9P2	273 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	NOD2	Q9HC29	1040 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183		I6L893	689 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	SERPINI2	O75830	405 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	FAM155B	O75949	473 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	TK1	P04183	234 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	FCGR1A	P12314	374 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	ABAT	P80404	500 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	MYCT1	Q8N699	235 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	TEX45	Q8NA69	505 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	AFG1L	Q8WV93	481 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	SSH2	Q76I76	1423 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	KIAA0232	Q92628	1395 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	ABCC6	O95255	1503 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	KCNJ13	O60928	360 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	CSF1	P09603	554 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	ARSA	P15289	507 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	AVPR2	P30518	371 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	GRK6	P43250	576 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	BIRC2	Q13490	618 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	CUL4B	Q13620	913 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	SPATA5	Q8NB90	893 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	TMEM18	Q96B42	140 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	RTP4	Q96DX8	246 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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