RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 SUOXP51687 545 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 BASP1P80723 227 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 SKOR1P84550 965 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 GUCY2DQ02846 1103 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 ZBTB16Q05516 673 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 FAM46CQ5VWP2 391 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 KCTD11Q693B1 232 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 IL17RCQ8NAC3 791 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 GLIS1Q8NBF1 620 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 LRRN4Q8WUT4 740 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 SORCS1Q8WY21 1168 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 PPP1R16AQ96I34 528 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 FEM1CQ96JP0 617 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 TRIM51Q9BSJ1 452 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 ADGRE3Q9BY15 652 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 ARNT2Q9HBZ2 717 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 EPB41L5Q9HCM4 733 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 GDF3Q9NR23 364 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 IL36AQ9UHA7 158 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 ANAPC5Q9UJX4 755 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 SCML1Q9UN30 329 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 TTLL3Q9Y4R7 772 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 NUP205Q92621 2012 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 PPFIA2O75334 1257 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 EPHX1P07099 455 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 APRTP07741 180 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 MMP2P08253 660 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 ETS1P14921 441 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 HLA-DPA1P20036 260 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 TIE1P35590 1138 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 CD86P42081 329 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 MAXP61244 160 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 DSC2Q02487 901 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 CDK18Q07002 472 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 NIPAL4Q0D2K0 466 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 FZD5Q13467 585 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 LAMB3Q13751 1172 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 KCNJ11Q14654 390 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 C9orf64Q5T6V5 341 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 IZUMO3Q5VZ72 239 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 WDR93Q6P2C0 686 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 BRAT1Q6PJG6 821 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 MAMSTRQ6ZN01 415 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 Q6ZVU0 165 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 NAT8LQ8N9F0 302 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 CPT1BQ92523 772 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 IFT43Q96FT9 208 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP11.81□□□□□ -0.522e-12■■■■■ 40.1
NISCH-211ENST00000488243 FSD1LQ9BXM9 530 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 CEP41Q9BYV8 373 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 TM6SF2Q9BZW4 377 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 NOD2Q9HC29 1040 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 DKK3Q9UBP4 350 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 HCN2Q9UL51 889 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 MMP17Q9ULZ9 603 aa11.81□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 MYOFQ9NZM1 2061 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 SLC30A4O14863 429 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP11.8□□□□□ -0.523e-7■■■■□ 20.1
NISCH-211ENST00000488243 RNF40O75150 1001 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 SIN3BO75182 1162 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 NDST3O95803 873 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 ADH1BP00325 375 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 FGF1P05230 155 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 RHOXF2BP0C7M4 288 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 PRKCHP24723 683 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 ADRA1AP35348 466 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 RPL21P46778 160 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 RGRP47804 291 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 VPS41P49754 854 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 NRLP54845 237 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 WNT3AP56704 352 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 SLC7A5Q01650 507 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 DMWDQ09019 674 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 CDH17Q12864 832 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 C2orf27AQ580R0 203 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 ARMC12Q5T9G4 340 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 EMC10Q5UCC4 262 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 LAIR1Q6GTX8 287 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 KDELC1Q6UW63 502 aa11.8□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 RANBP10Q6VN20 620 aa11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms