RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ASB2Q96Q27 587 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HMGXB4Q9UGU5 601 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYBPHLA2RUH7 354 aa16.69■□□□□ 0.26
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPL38P63173 70 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC26A9Q7LBE3 791 aa16.69■□□□□ 0.26
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 INHBEP58166 350 aa16.69■□□□□ 0.26
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLEC4CQ8WTT0 213 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C7orf43Q8WVR3 580 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C9orf16Q9BUW7 83 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COQ4Q9Y3A0 265 aa16.69■□□□□ 0.26
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DLG2Q15700 870 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STK40Q8N2I9 435 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CORO1BQ9BR76 489 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PADI3Q9ULW8 664 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GIT1Q9Y2X7 761 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C9JVG2 144 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GSC2O15499 205 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM20BO75063 409 aa16.68■□□□□ 0.26
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCDH19Q8TAB3 1148 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCDHGC3Q9UN70 934 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYH3P11055 1940 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KAT6AQ92794 2004 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRT87PA6NCN2 255 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COX7A2P14406 83 aa16.68■□□□□ 0.26
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa16.68■□□□□ 0.26
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPM1LQ5SGD2 360 aa16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARPINQ7Z6K5 226 aa16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SIAH1Q8IUQ4 282 aa16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF276Q8N554 614 aa16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ELMO1Q92556 727 aa16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MIEF2Q96C03 454 aa16.67■□□□□ 0.26
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C2CD4BA6NLJ0 364 aa16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VCLP18206 1134 aa16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LPOP22079 712 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PIK3CGP48736 1102 aa16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TTPAP49638 278 aa16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IKBKEQ14164 716 aa16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP16.67■□□□□ 0.269e-6■■■■■ 29.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 USP45Q70EL2 814 aa16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPG21Q9NZD8 308 aa16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC12A4Q9UP95 1085 aa16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AZIN1O14977 448 aa16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM63AO94886 807 aa16.67■□□□□ 0.26
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