RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 ZNF767PQ75MW2 155 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 PRSS48Q7RTY5 328 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 HERC6Q8IVU3 1022 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 C12orf56Q8IXR9 622 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 UNC5BQ8IZJ1 945 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 FAM109AQ8N4B1 249 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 NATD1Q8N6N6 113 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 KYQ8NBH2 561 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 ABHD11Q8NFV4 315 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 ZNF384Q8TF68 577 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 CAPSLQ8WWF8 208 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 TMIGD2Q96BF3 282 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 ASB9Q96DX5 294 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 CEP295NLQ96MC4 621 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 CLSTN3Q9BQT9 956 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 MRIQ9BWK5 157 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 SNX25Q9H3E2 840 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 VPS37BQ9H9H4 285 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 FANCEQ9HB96 536 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 NECTIN3Q9NQS3 549 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 ARMCX1Q9P291 453 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 ANAPC2Q9UJX6 822 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 STOML2Q9UJZ1 356 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 TCAF1Q9Y4C2 921 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 ADGRA2Q96PE1 1338 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 CROCCQ5TZA2 2017 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 A0A1W2PPW3 197 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 SMCO2A6NFE2 343 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 PP2D1A8MPX8 630 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 PI4K2BG5E9Z4 385 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 YKT6O15498 198 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 NDUFA2O43678 99 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 NDUFS2O75306 463 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 PRDM1O75626 825 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 GHRHP01286 108 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 HMGN1P05114 100 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 BPGMP07738 259 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 JMJD7P0C870 316 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 BGNP21810 368 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 RBL1P28749 1068 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 PTGS2P35354 604 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 DDOSTP39656 456 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 CBX5P45973 191 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 CPA2P48052 419 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 PRKAA2P54646 552 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 PEX3P56589 373 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 GABARAPL2P60520 117 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 SLC25A3Q00325 362 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 BNIP3Q12983 259 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 GBX1Q14549 363 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 GRM4Q14833 912 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 TSC22D1Q15714 1073 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 DGUOKQ16854 277 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 SBK1Q52WX2 424 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 FGD3Q5JSP0 725 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 ZNF484Q5JVG2 852 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 LRRC38Q5VT99 294 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 AGAP9Q5VTM2 703 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 SLFN13Q68D06 897 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 CYP4F22Q6NT55 531 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 GALNT18Q6P9A2 607 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 ZNF773Q6PK81 442 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 RFX8Q6ZV50 586 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 NIPA1Q7RTP0 329 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 FGD2Q7Z6J4 655 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 SLC26A11Q86WA9 606 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 ZNF677Q86XU0 584 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 NUDCD3Q8IVD9 361 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 PPIL6Q8IXY8 311 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 TBC1D21Q8IYX1 336 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 ADGRF2Q8IZF7 708 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 SFRP1Q8N474 314 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-211ENST00000481115 SLC25A41Q8N5S1 370 aa7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms