RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 AKT2P31751 481 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 SUOXP51687 545 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 MAXP61244 160 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 TMEM52BQ4KMG9 183 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 ODF2Q5BJF6 829 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 KIAA1328Q86T90 577 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 IQCHQ86VS3 1027 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 RFX6Q8HWS3 928 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 KRT35Q92764 455 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 MYOCQ99972 504 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 NOD2Q9HC29 1040 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 NT5MQ9NPB1 228 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 TRPM6Q9BX84 2022 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 CACNA1AO00555 2505 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 SPTBN2O15020 2390 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 RAD51BO15315 384 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 MMP20O60882 483 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 ZNF883P0CG24 379 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 XPAP23025 273 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 NXPH1P58417 271 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 PPM1JQ5JR12 505 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 RALGPS1Q5JS13 557 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 NPNTQ6UXI9 565 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 CCDC13Q8IYE1 715 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 ASB12Q8WXK4 309 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 HDAC11Q96DB2 347 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 LGMNQ99538 433 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 PCDH12Q9NPG4 1184 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 SCUBE2Q9NQ36 999 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 TM7SF3Q9NS93 570 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP21.13■□□□□ 0.971e-15■□□□□ 9.1
ACTB-211ENST00000480301 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 HEY1Q9Y5J3 304 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa21.12■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP21.12■□□□□ 0.971e-16■■■□□ 16.5
ACTB-211ENST00000480301 KRT10P13645 584 aa21.12■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 CLDN2P57739 230 aa21.12■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 ADCY2Q08462 1091 aa21.12■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 ELP6Q0PNE2 266 aa21.12■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 OVGP1Q12889 678 aa21.12■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 SGCGQ13326 291 aa21.12■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 CFAP58Q5T655 872 aa21.12■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 DBX2Q6ZNG2 339 aa21.12■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 GCNT7Q6ZNI0 430 aa21.12■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 RCOR2Q8IZ40 523 aa21.12■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 LRRC57Q8N9N7 239 aa21.12■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 CCNYQ8ND76 341 aa21.12■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 DEFB124Q8NES8 71 aa21.12■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 CXorf40AQ8TE69 158 aa21.12■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 BMFQ96LC9 184 aa21.12■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 OLFM3Q96PB7 478 aa21.12■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 TRIM10Q9UDY6 481 aa21.12■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 SHROOM3Q8TF72 1996 aa21.11■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 GRID2IPA4D2P6 1211 aa21.11■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 GIPC1O14908 333 aa21.11■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 PRKCGP05129 697 aa21.11■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 CCNB1P14635 433 aa21.11■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 DYNLT1P63172 113 aa21.11■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 LLGL1Q15334 1064 aa21.11■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 ALG1LQ6GMV1 187 aa21.11■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 ERAP2Q6P179 960 aa21.11■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa21.11■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 EXD1Q8NHP7 514 aa21.11■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 KIAA1524Q8TCG1 905 aa21.11■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 SPOCK2Q92563 424 aa21.11■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 KLHDC7BQ96G42 594 aa21.11■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 GDF3Q9NR23 364 aa21.11■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 AMACRQ9UHK6 382 aa21.11■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa21.11■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP21.11■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa21.11■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa21.11■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 A0A1B0GTQ1 180 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 SH3BP5O60239 455 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 DFNA5O60443 496 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 CST8O60676 142 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 MAGEC1O60732 1142 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 SOCS5O75159 536 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 THEGLP0DJG4 465 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 CTNNA2P26232 953 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 MMP12P39900 470 aa21.1■□□□□ 0.97
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