RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa6.49□□□□□ -1.37
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PRKCI-202ENST00000476635 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
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PRKCI-202ENST00000476635 H0Y858 1186 aa6.48□□□□□ -1.37
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