RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473542.1

BBX-223, Transcript of BBX, HMG-box containing, human

TSL 3

Gene BBX, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBX-223	ENST00000473542	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	TNFSF8	P32971	234 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	PBX3	P40426	434 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	CLDN2	P57739	230 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	MC1R	Q01726	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	EPS8	Q12929	822 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	WTAP	Q15007	396 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	PPP2R5B	Q15173	497 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	KRT24	Q2M2I5	525 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	RBFA	Q8N0V3	343 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	EME1	Q96AY2	570 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	COQ8B	Q96D53	544 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	PGAM5	Q96HS1	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	CDT1	Q9H211	546 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	ABI3	Q9P2A4	366 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	POLG2	Q9UHN1	485 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542		A0A0U1RQF3	1178 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542		A8MZ25	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	KLRF2	D3W0D1	207 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	IKBKB	O14920	756 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	MDM4	O15151	490 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	SEC14L5	O43304	696 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	ATG13	O75143	517 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	IFNA2	P01563	188 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	CSH1	P0DML2	217 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	CSH2	P0DML3	217 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	SRD5A1	P18405	259 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	MPG	P29372	298 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	RAD52	P43351	418 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	ZNF91	Q05481	1191 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	FAM27E3	Q08E93	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	TOMM20	Q15388	145 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	MED22	Q15528	200 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	TCTN1	Q2MV58	587 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	TTI2	Q6NXR4	508 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	KLHL35	Q6PF15	583 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	TEX45	Q8NA69	505 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	ZBTB9	Q96C00	473 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	BBS4	Q96RK4	519 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	TRMO	Q9BU70	441 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	KLHL31	Q9H511	634 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	SH2D4A	Q9H788	454 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	KAT14	Q9H8E8	782 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	MKLN1	Q9UL63	735 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	MTMR6	Q9Y217	621 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	HSPB2	A8KAH6	182 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	SLC25A17	O43808	307 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	OR2C1	O95371	312 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	AGA	P20933	346 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	DCTD	P32321	178 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	UBA7	P41226	1012 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	RASSF2	P50749	326 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	NLRP5	P59047	1200 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	NUCB1	Q02818	461 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	CHAF1B	Q13112	559 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	RUNX2	Q13950	521 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	FGFBP1	Q14512	234 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	HSPB2	Q16082	182 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	DCAF6	Q58WW2	860 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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