RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470944.1

SOD1-203, Transcript of superoxide dismutase 1, humanhuman

TSL 2

Gene SOD1, Length 1,746 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD1-203ENST00000470944 AOC1P19801 751 aa29.1■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 TPSB2P20231 275 aa29.1■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 DRG2P55039 364 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 TPSAB1Q15661 275 aa29.1■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 CST6Q15828 149 aa29.1■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa29.1■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 RANBP10Q6VN20 620 aa29.1■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 SPEM1Q8N4L4 309 aa29.1■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 IFT43Q96FT9 208 aa29.1■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 FEM1CQ96JP0 617 aa29.1■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 TBL1YQ9BQ87 522 aa29.1■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa29.1■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 WHRNQ9P202 907 aa29.1■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 PLK4O00444 970 aa29.09■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 MTM1Q13496 603 aa29.09■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 PTPRRQ15256 657 aa29.09■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 ZNF805Q5CZA5 627 aa29.09■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 DENND5AQ6IQ26 1287 aa29.09■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 ZNF534Q76KX8 674 aa29.09■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 SLC25A41Q8N5S1 370 aa29.09■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 UBXN4Q92575 508 aa29.09■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 ARRDC3Q96B67 414 aa29.09■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 MRGPRX1Q96LB2 322 aa29.09■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 ANAPC5Q9UJX4 755 aa29.09■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 MID1O15344 667 aa29.08■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 NDUFV2P19404 249 aa29.08■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 ITIH2P19823 946 aa29.08■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 DGKEP52429 567 aa29.08■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 LRRC73Q5JTD7 316 aa29.08■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 ARMC12Q5T9G4 340 aa29.08■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 ZDHHC24Q6UX98 284 aa29.08■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 PCGF5Q86SE9 256 aa29.08■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 LPCAT1Q8NF37 534 aa29.08■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 OR52K1Q8NGK4 314 aa29.08■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 PIH1D2Q8WWB5 315 aa29.08■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 EPHX3Q9H6B9 360 aa29.08■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 GDF3Q9NR23 364 aa29.08■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 PSMD3O43242 534 aa29.08■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 GABRG2P18507 467 aa29.08■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 SLC8A1P32418 973 aa29.08■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 MORF4L2Q15014 288 aa29.08■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 SLC1A5Q15758 541 aa29.08■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 SIRPB2Q5JXA9 342 aa29.08■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 PWWP2AQ96N64 755 aa29.08■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 HHIPQ96QV1 700 aa29.08■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 FBRSQ9HAH7 460 aa29.08■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
SOD1-203ENST00000470944 C16orf96A6NNT2 1141 aa29.07■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa29.07■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 EPOP01588 193 aa29.07■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 PRKCGP05129 697 aa29.07■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 CA4P22748 312 aa29.07■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 PLTPP55058 493 aa29.07■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 CALCOCO2Q13137 446 aa29.07■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 AADATQ8N5Z0 425 aa29.07■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 PAF1Q8N7H5 531 aa29.07■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 HMGB4Q8WW32 186 aa29.07■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 NEUROG2Q9H2A3 272 aa29.07■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 ANKRD36A6QL64 1941 aa29.07■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 NDST3O95803 873 aa29.06■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 ITGB7P26010 798 aa29.06■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 CARSP49589 748 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 TUBB4BP68371 445 aa29.06■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 CDK16Q00536 496 aa29.06■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 CFAP58Q5T655 872 aa29.06■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa29.06■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 HOOK3Q86VS8 718 aa29.06■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 IFT81Q8WYA0 676 aa29.06■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 ART4Q93070 314 aa29.06■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 DKK3Q9UBP4 350 aa29.06■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 SERGEFQ9UGK8 458 aa29.06■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 SHOC2Q9UQ13 582 aa29.06■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 TSPAN11A1L157 253 aa29.06■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 AVILO75366 819 aa29.06■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 CPP00450 1065 aa29.06■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 DRD3P35462 400 aa29.06■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 FAM46CQ5VWP2 391 aa29.06■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
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SOD1-203ENST00000470944 SPOCK2Q92563 424 aa29.06■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 PBXIP1Q96AQ6 731 aa29.06■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 RMDN1Q96DB5 314 aa29.06■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 ADH1BP00325 375 aa29.05■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 TIMP2P16035 220 aa29.05■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 CTPS1P17812 591 aa29.05■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 CLCN5P51795 746 aa29.05■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 QPCTQ16769 361 aa29.05■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 ANO7Q6IWH7 933 aa29.05■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 BRAT1Q6PJG6 821 aa29.05■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa29.05■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 BBOF1Q8ND07 529 aa29.05■■■□□ 2.24
SOD1-203ENST00000470944 MCUQ8NE86 351 aa29.05■■■□□ 2.24
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