RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 IL10RBQ08334 325 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 BFSP2Q13515 415 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 ADRM1Q16186 407 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 TRIM60Q495X7 471 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 TSTD2Q5T7W7 516 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 FAM45BPQ6NSW5 357 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 GLB1LQ6UWU2 654 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 CHSY3Q70JA7 882 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 MAVSQ7Z434 540 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 PDSS2Q86YH6 399 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 GOLM1Q8NBJ4 401 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 ICA1LQ8NDH6 482 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 IPMKQ8NFU5 416 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 GPR150Q8NGU9 434 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 FAM45AQ8TCE6 357 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 SLC26A7Q8TE54 656 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 TSPEARQ8WU66 669 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 BTN2A3PQ96KV6 586 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 CYP2S1Q96SQ9 504 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 TCF12Q99081 682 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 TTC1Q99614 292 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 CCT7Q99832 543 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 CENPKQ9BS16 269 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 EFHD1Q9BUP0 239 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 FTHL17Q9BXU8 183 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 SIK2Q9H0K1 926 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 MFSD1Q9H3U5 465 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 ZNF385DQ9H6B1 395 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 ZBTB26Q9HCK0 441 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 ANLNQ9NQW6 1124 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 RAB26Q9ULW5 256 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 VWA7Q9Y334 891 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 CASTOR2A6NHX0 329 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 BBIP1A8MTZ0 92 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 GRID2O43424 1007 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 DENRO43583 198 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 BUD23O43709 281 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 DLX3O60479 287 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 SMIM24O75264 130 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 GPC4O75487 556 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 IPO13O94829 963 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 PARNO95453 639 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 CAPNS1P04632 268 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 FGF1P05230 155 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 FGF4P08620 206 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 CPB1P15086 417 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 PCSK2P16519 638 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 TPH1P17752 444 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 IMPDH1P20839 514 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 CD9P21926 228 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 SP100P23497 879 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 CACNA2D1P54289 1103 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 INHBCP55103 352 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 WNT3AP56704 352 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 TBX4P57082 545 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 FAM189BP81408 668 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 NFKB2Q00653 900 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 ACVR1Q04771 509 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 GRIK2Q13002 908 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 USP4Q13107 963 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 SQLEQ14534 574 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 CNGA3Q16281 694 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 MRNIPQ6NTE8 343 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 PRMT9Q6P2P2 845 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 KDELC1Q6UW63 502 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 IZUMO2Q6UXV1 221 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 NAPRTQ6XQN6 538 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 FRMD7Q6ZUT3 714 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 SLC24A5Q71RS6 500 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 OTOP3Q7RTS5 596 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 C3orf58Q8NDZ4 430 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 RHEBL1Q8TAI7 183 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 ZFAND2BQ8WV99 257 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 KCTD4Q8WVF5 259 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 TADA1Q96BN2 335 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 L3HYPDHQ96EM0 354 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
ACTB-208ENST00000464611 ELMO2Q96JJ3 720 aa8.57□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms