RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 CHST2Q9Y4C5 530 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 ADGRL1O94910 1474 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 UTYO14607 1347 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A1B0GTL3 188 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A1B0GVM2 712 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 TCAF2A6NFQ2 919 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 IFNL4K9M1U5 179 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 PGRMC2O15173 223 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 SEC14L5O43304 696 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 SUV39H1O43463 412 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 B4GALT3O60512 393 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 CNTN5O94779 1100 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 NKX2-2O95096 273 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 OLFM2O95897 454 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 ACTN1P12814 892 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC2A4P14672 509 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 KRT4P19013 534 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 DIO1P49895 249 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 PDE1AP54750 535 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC12A3P55017 1021 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 NXPH1P58417 271 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 RALGDSQ12967 914 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 GAB1Q13480 694 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 ITGA7Q13683 1181 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 RCN2Q14257 317 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF273Q14593 569 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 CNGA3Q16281 694 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 RPE65Q16518 533 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 GALNT17Q6IS24 598 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 WDR73Q6P4I2 378 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 CASC1Q6TDU7 716 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 UNC5DQ6UXZ4 953 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 HTR3DQ70Z44 454 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 AACSQ86V21 672 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 LURAP1LQ8IV03 231 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 HACE1Q8IYU2 909 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 SYCP3Q8IZU3 236 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 TSPAN14Q8NG11 270 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 SEPT1Q8WYJ6 367 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 CORO2AQ92828 525 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 FKBP10Q96AY3 582 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM68Q96MH6 324 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 SPXQ9BT56 116 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 ABCB8Q9NUT2 735 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 PCMTD2Q9NV79 361 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 ARL15Q9NXU5 204 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 FZD4Q9ULV1 537 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 COG5Q9UP83 839 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 DTX4Q9Y2E6 619 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 LIPGQ9Y5X9 500 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 MROH2BQ7Z745 1585 aa4.81□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.8□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa4.8□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 KRT87PA6NCN2 255 aa4.8□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa4.8□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC188H7C350 402 aa4.8□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 NDC80O14777 642 aa4.8□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 TXNL1O43396 289 aa4.8□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 PROM1O43490 865 aa4.8□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 STAM2O75886 525 aa4.8□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 SLCO2B1O94956 709 aa4.8□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 GUCA1CO95843 209 aa4.8□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 FCGR2AP12318 317 aa4.8□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 IL7RP16871 459 aa4.8□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 TNFRSF1AP19438 455 aa4.8□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 NDUFS1P28331 727 aa4.8□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 CTGFP29279 349 aa4.8□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP4.8□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP2CBP62714 309 aa4.8□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP2CAP67775 309 aa4.8□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 FOXL1Q12952 345 aa4.8□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNC3Q14003 757 aa4.8□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 SHBQ15464 509 aa4.8□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 COL28A1Q2UY09 1125 aa4.8□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa4.8□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa4.8□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa4.8□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa4.8□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms