RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432547.7

TTR-202, Transcript of transthyretin, humanhuman

TSL 2

Gene TTR, Length 745 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-202ENST00000432547 TUBP50607 506 aa6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 LRRC63Q05C16 580 aa6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 ENPEPQ07075 957 aa6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 ELF2Q15723 593 aa6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 CCDC6Q16204 474 aa6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 CRY1Q16526 586 aa6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 DPCR1Q3MIW9 517 aa6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 ZNF667Q5HYK9 610 aa6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 PMS2CLQ68D20 193 aa6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 RHBDF2Q6PJF5 856 aa6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 GPR155Q7Z3F1 870 aa6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 RASSF3Q86WH2 238 aa6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 FUKQ8N0W3 1084 aa6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 SCAMP5Q8TAC9 235 aa6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 OTUB2Q96DC9 234 aa6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 ZNF503Q96F45 646 aa6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 SMARCD1Q96GM5 515 aa6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 AJUBAQ96IF1 538 aa6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 TNIP3Q96KP6 325 aa6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 KCNK16Q96T55 309 aa6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 PNKPQ96T60 521 aa6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 TSG101Q99816 390 aa6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 TRIM39Q9HCM9 518 aa6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 VPS45Q9NRW7 570 aa6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 COMMD8Q9NX08 183 aa6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 LUZP4Q9P127 313 aa6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 CFAP97Q9P2B7 532 aa6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 HMGXB4Q9UGU5 601 aa6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 ZFHX4Q86UP3 3567 aa6.69□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 DCLK1O15075 740 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 COCHO43405 550 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 RHOBTB1O94844 696 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 FBXO21O94952 628 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 KAT7O95251 611 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 P4HA1P13674 534 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 MXI1P50539 228 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 DGKEP52429 567 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 SLC5A3P53794 718 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 PAK1Q13153 545 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 STIM1Q13586 685 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 FHL2Q14192 279 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 ZNF460Q14592 562 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 HECTD3Q5T447 861 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 STPG1Q5TH74 334 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 ANO7Q6IWH7 933 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 ACOT1Q86TX2 421 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 C11orf74Q86VG3 221 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 UNC93AQ86WB7 457 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 SFTPA1Q8IWL2 248 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 CRYBG2Q8N1P7 616 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 ANKRD42Q8N9B4 389 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 TRIML1Q8N9V2 468 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 IL17RCQ8NAC3 791 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 VPS37AQ8NEZ2 397 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 ZMIZ2Q8NF64 920 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 MDGA1Q8NFP4 955 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 TSTD1Q8NFU3 115 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 OLIG1Q8TAK6 271 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 TAF4BQ92750 862 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 FBXO32Q969P5 355 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 SLC35C1Q96A29 364 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 GBP4Q96PP9 640 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 TWNKQ96RR1 684 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 SMOQ99835 787 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 JAM3Q9BX67 310 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 TPSD1Q9BZJ3 242 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 NUP62CLQ9H1M0 184 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 TMEM8AQ9HCN3 771 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 DLL4Q9NR61 685 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 TBC1D14Q9P2M4 693 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 NUMA1Q14980 2115 aa6.68□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 CEP295Q9C0D2 2601 aa6.67□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 DOCK9Q9BZ29 2069 aa6.67□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 ZZEF1O43149 2961 aa6.67□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 SGK1O00141 431 aa6.67□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 NEMP1O14524 444 aa6.67□□□□□ -1.34
TTR-202ENST00000432547 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
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