RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 TRIM42Q8IWZ5 723 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 NUDCD1Q96RS6 583 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 KDM4CQ9H3R0 1056 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 KLHL14Q9P2G3 628 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 VPS51Q9UID3 782 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 FBXO5Q9UKT4 447 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 CCL22O00626 93 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 C2P06681 752 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 PFKLP17858 780 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 HADHAP40939 763 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 ARSDP51689 593 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 PGGT1BP53609 377 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 UBE3AQ05086 875 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 RNF43Q68DV7 783 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 TPGS1Q6ZTW0 290 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 CLEC14AQ86T13 490 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 MFSD6LQ8IWD5 586 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 NPHS2Q9NP85 383 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 PLK2Q9NYY3 685 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP21.74■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 LHX3Q9UBR4 397 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 CLEC4EQ9ULY5 219 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 ARL5AQ9Y689 179 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 C5orf67F2Z3F1 127 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 AURKAO14965 403 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 MOSPD3O75425 235 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 EPCAMP16422 314 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 SAT1P21673 171 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 EPHA5P54756 1037 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 NLRP9Q7RTR0 991 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 APCDD1Q8J025 514 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 C10orf82Q8WW14 230 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 CCL26Q9Y258 94 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 BUD23O43709 281 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 HAUS5O94927 633 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 GSTA1P08263 222 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 PTPN2P17706 415 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 ALDH3A1P30838 453 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 TMPRSS15P98073 1019 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 BST1Q10588 318 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 USP10Q14694 798 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 PTPRCAPQ14761 206 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 PCLAFQ15004 111 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 TEAD2Q15562 447 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 MPPE1Q53F39 396 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 SH3RF2Q8TEC5 729 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 HDAC10Q969S8 669 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 PLCD4Q9BRC7 762 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 GRXCR1A8MXD5 290 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC7A4O43246 635 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 PRLP01236 227 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 IL1BP01584 269 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 CES1P23141 567 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 AVPR1AP37288 418 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 CD151P48509 253 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 FYB2Q5VWT5 728 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 ATG16L1Q676U5 607 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 PNPLA1Q8N8W4 532 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 DCAF4L2Q8NA75 395 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 RFWD2Q8NHY2 731 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 RIN3Q8TB24 985 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 CALML6Q8TD86 181 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 BRSK1Q8TDC3 778 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 OR51F1A6NGY5 319 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 MYO1CO00159 1063 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 RHOP08100 348 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 PDHA1P08559 390 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 ACVR1Q04771 509 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF789Q5FWF6 425 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 CNSTQ6PJW8 725 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 KIAA0408Q6ZU52 694 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 RAPH1Q70E73 1250 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 CMTM8Q8IZV2 173 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 OR13C4Q8NGS5 318 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 TBATAQ96M53 351 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 MFSD1Q9H3U5 465 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 SPO11Q9Y5K1 396 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 RAI2Q9Y5P3 530 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 MT-CO1P00395 513 aa21.7■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP21.7■■□□□ 1.07
SH3BP5-204ENST00000412806 KCNA4P22459 653 aa21.7■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms