RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409435.5

SCN9A-202, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 9, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN9A, Length 5,967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9A-202ENST00000409435 SH3GLB1Q9Y371 365 aa7.36□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 DTNAQ9Y4J8 743 aa7.36□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 ANGPT2O15123 496 aa7.36□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 USP1O94782 785 aa7.36□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 GUCA1CO95843 209 aa7.36□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 ALBP02768 609 aa7.36□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 CES1P23141 567 aa7.36□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 VARSP26640 1264 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 CASP4P49662 377 aa7.36□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 NEK3P51956 506 aa7.36□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 SCUBE3Q8IX30 993 aa7.36□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 UBASH3BQ8TF42 649 aa7.36□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 COG1Q8WTW3 980 aa7.36□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 HEXDCQ8WVB3 486 aa7.36□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 DUSP16Q9BY84 665 aa7.36□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 SLAMF7Q9NQ25 335 aa7.36□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa7.36□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 BTAF1O14981 1849 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 EVPLLA8MZ36 301 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 H0Y858 1186 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 LEFTY2O00292 366 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 AREL1O15033 823 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 DGKIO75912 1065 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 FTH1P02794 183 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 UGT2B4P06133 528 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 DCNP07585 359 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 SCNN1AP37088 669 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 GNPDA1P46926 289 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 CENPAP49450 140 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 VBP1P61758 197 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 SLC6A3Q01959 620 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 ALG11Q2TAA5 492 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 TRIM61Q5EBN2 209 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 TRIM65Q6PJ69 517 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 P4HA3Q7Z4N8 544 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 ZNF786Q8N393 782 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 ANKRD52Q8NB46 1076 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 ZNF285Q96NJ3 590 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 VPS11Q9H270 941 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 FAM221BA6H8Z2 402 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 GRXCR2A6NFK2 248 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 TGM5O43548 720 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 KITP10721 976 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 CYP11B1P15538 503 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 RGS21Q2M5E4 152 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 CCDC81Q6ZN84 652 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 STK32CQ86UX6 486 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 TM9SF4Q92544 642 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 TMEM125Q96AQ2 219 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 WNT8AQ9H1J5 351 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 MCCC2Q9HCC0 563 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 IL36AQ9UHA7 158 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 PXNP49023 591 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 SLC7A5Q01650 507 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 MC1RQ01726 317 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 TXNDC11Q6PKC3 985 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 OTOAQ7RTW8 1153 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 SLC9B2Q86UD5 537 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 FBXL6Q8N531 539 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 RXFP2Q8WXD0 754 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 ELMO1Q92556 727 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 CCT8L2Q96SF2 557 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 FICDQ9BVA6 458 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 DNAJC18Q9H819 358 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 HMG20AQ9NP66 347 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 GJD2Q9UKL4 321 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 CCDC182A6NF36 153 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 KPNA5O15131 536 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 KAT7O95251 611 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 PIK3R1P27986 724 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 HOXC8P31273 242 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 MAGEA2P43356 314 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 KCNJ5P48544 419 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 PDZK1Q5T2W1 519 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 ERMARDQ5T6L9 678 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 NEK10Q6ZWH5 1172 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 C16orf62Q7Z3J2 963 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 PIGZQ86VD9 579 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 TMEM126BQ8IUX1 230 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 CFAP52Q8N1V2 620 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 WNT8BQ93098 351 aa7.35□□□□□ -1.23
SCN9A-202ENST00000409435 CDC6Q99741 560 aa7.35□□□□□ -1.23
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