RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 DPYSL3Q14195 570 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM52BQ4KMG9 183 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC35G2Q8TBE7 412 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2E3-201ENST00000392415 CXorf40AQ8TE69 158 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2E3-201ENST00000392415 CENPTQ96BT3 561 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2E3-201ENST00000392415 IFT43Q96FT9 208 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2E3-201ENST00000392415 CALN1Q9BXU9 219 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2E3-201ENST00000392415 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2E3-201ENST00000392415 FTSJ1Q9UET6 329 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2E3-201ENST00000392415 KLK13Q9UKR3 277 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2E3-201ENST00000392415 FPGTO14772 594 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2E3-201ENST00000392415 MMP20O60882 483 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2E3-201ENST00000392415 TM7SF2O76062 418 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2E3-201ENST00000392415 KRT7P08729 469 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2E3-201ENST00000392415 RABIFP47224 123 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2E3-201ENST00000392415 PDK2Q15119 407 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2E3-201ENST00000392415 CFAP58Q5T655 872 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2E3-201ENST00000392415 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
UBE2E3-201ENST00000392415 ZSWIM9Q86XI8 627 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2E3-201ENST00000392415 LRRC49Q8IUZ0 686 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2E3-201ENST00000392415 ATPAF2Q8N5M1 289 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2E3-201ENST00000392415 EID2Q8N6I1 236 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2E3-201ENST00000392415 KCTD6Q8NC69 237 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2E3-201ENST00000392415 ECHDC3Q96DC8 303 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF670Q9BS34 389 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2E3-201ENST00000392415 MSRB2Q9Y3D2 182 aa20.78■□□□□ 0.92
UBE2E3-201ENST00000392415 PTPRBP23467 1997 aa20.77■□□□□ 0.92
UBE2E3-201ENST00000392415 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 MTA2O94776 668 aa20.77■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 GJC1P36383 396 aa20.77■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 SCNN1BP51168 640 aa20.77■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 AP1S1P61966 158 aa20.77■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 BCL2L1Q07817 233 aa20.77■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 MAP7D3Q8IWC1 876 aa20.77■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 TC2NQ8N9U0 490 aa20.77■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 PCDH19Q8TAB3 1148 aa20.77■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 NSMCE3Q96MG7 304 aa20.77■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 PCDH12Q9NPG4 1184 aa20.77■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 USP24Q9UPU5 2620 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 SDC3O75056 442 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 CR2P20023 1033 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 ARHGAP25P42331 645 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 PFN3P60673 137 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 FZD2Q14332 565 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF235Q14590 738 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 MESDQ14696 234 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 ERAP2Q6P179 960 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 RHOT2Q8IXI1 618 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC25A45Q8N413 288 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 GATA6Q92908 595 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 FAF2Q96CS3 445 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 INTUQ9ULD6 942 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 IGF2RP11717 2491 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 FREM2Q5SZK8 3169 aa20.75■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 GOLGA8CPA6NN73 597 aa20.75■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa20.75■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 ENC1O14682 589 aa20.75■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 DGKAP23743 735 aa20.75■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 TCEAL1Q15170 157 aa20.75■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa20.75■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa20.75■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 BBS5Q8N3I7 341 aa20.75■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 PGBD5Q8N414 524 aa20.75■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 NSMCE1Q8WV22 266 aa20.75■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 RFFLQ8WZ73 363 aa20.75■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 SPOCK2Q92563 424 aa20.75■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 MGME1Q9BQP7 344 aa20.75■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa20.75■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 KNTC1P50748 2209 aa20.74■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 CACNA1BQ00975 2339 aa20.74■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 CFAP69A5D8W1 941 aa20.74■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa20.74■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 MFSD11O43934 449 aa20.74■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 PIAS2O75928 621 aa20.74■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 C1QTNF9P0C862 333 aa20.74■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 IGFALSP35858 605 aa20.74■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 MMP12P39900 470 aa20.74■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 AGERQ15109 404 aa20.74■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 RALGPS1Q5JS13 557 aa20.74■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 MARC1Q5VT66 337 aa20.74■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 NUDCD1Q96RS6 583 aa20.74■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa20.74■□□□□ 0.91
UBE2E3-201ENST00000392415 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms