RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379215.8

ECHDC3-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHDC3, Length 1,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-201ENST00000379215 ELOVL2Q9NXB9 296 aa24.76■■□□□ 1.55
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ECHDC3-201ENST00000379215 A0A1W2PQ67 120 aa24.75■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 SMIM23A6NLE4 172 aa24.75■■□□□ 1.55
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ECHDC3-201ENST00000379215 SLCO1A2P46721 670 aa24.75■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa24.75■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 ARMC12Q5T9G4 340 aa24.75■■□□□ 1.55
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ECHDC3-201ENST00000379215 RMDN1Q96DB5 314 aa24.75■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
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ECHDC3-201ENST00000379215 CHKBQ9Y259 395 aa24.75■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 GRXCR2A6NFK2 248 aa24.75■■□□□ 1.55
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ECHDC3-201ENST00000379215 MGAT5Q09328 741 aa24.75■■□□□ 1.55
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ECHDC3-201ENST00000379215 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa24.75■■□□□ 1.55
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ECHDC3-201ENST00000379215 CERS2Q96G23 380 aa24.75■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 MYO19Q96H55 970 aa24.75■■□□□ 1.55
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ECHDC3-201ENST00000379215 DHRS4Q9BTZ2 278 aa24.75■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 TNKS2Q9H2K2 1166 aa24.75■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 GTSE1Q9NYZ3 720 aa24.75■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 HACD3Q9P035 362 aa24.75■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa24.75■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 MYOFQ9NZM1 2061 aa24.74■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 ARNTLO00327 626 aa24.74■■□□□ 1.55
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ECHDC3-201ENST00000379215 SLC6A11P48066 632 aa24.74■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 SEPT6Q14141 434 aa24.74■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 GALNT3Q14435 633 aa24.74■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 BRSK1Q8TDC3 778 aa24.74■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP24.74■■□□□ 1.55
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ECHDC3-201ENST00000379215 RIMKLBQ9ULI2 386 aa24.74■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa24.73■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 WASH3PC4AMC7 463 aa24.73■■□□□ 1.55
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ECHDC3-201ENST00000379215 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 TTMPQ5BVD1 217 aa24.73■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 PDPK2PQ6A1A2 396 aa24.73■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC26A11Q86WA9 606 aa24.73■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 CTAGE3PQ8IX95 158 aa24.73■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 LPCAT1Q8NF37 534 aa24.73■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC44A1Q8WWI5 657 aa24.73■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 MYLIPQ8WY64 445 aa24.73■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF180Q9UJW8 692 aa24.73■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 ANKRD66B4E2M5 251 aa24.72■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 PRLP01236 227 aa24.72■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 GRIA2P42262 883 aa24.72■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 EPHB1P54762 984 aa24.72■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 PDE1BQ01064 536 aa24.72■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 LGSNQ5TDP6 509 aa24.72■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 ADGRD1Q6QNK2 874 aa24.72■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 NDUFAF2Q8N183 169 aa24.72■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 PHTF2Q8N3S3 785 aa24.72■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa24.72■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
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ECHDC3-201ENST00000379215 MFSD3Q96ES6 412 aa24.72■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 NSMCE3Q96MG7 304 aa24.72■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 TRPV5Q9NQA5 729 aa24.72■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa24.72■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 EURLQ9NYK6 297 aa24.72■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 MIA3Q5JRA6 1907 aa24.72■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 C1QAP02745 245 aa24.72■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 FOSL2P15408 326 aa24.72■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 PTPRNQ16849 979 aa24.72■■□□□ 1.55
ECHDC3-201ENST00000379215 TSTD2Q5T7W7 516 aa24.72■■□□□ 1.55
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