RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364874.1

RNU6-34P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 34, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-34P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-34P-201ENST00000364874 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 PLEKHA3Q9HB20 300 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 KRT84Q9NSB2 600 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 ZNF69Q9UC07 566 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 KCNJ14Q9UNX9 436 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 TNFSF13BQ9Y275 285 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 A0A087WW49 117 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 DUXAA6NLW8 204 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 SLCO1B7G3V0H7 640 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 CLIC2O15247 247 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 IDH3BO43837 385 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 EML2O95834 649 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 HPP00738 406 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 IGHV4-39P01824 125 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 MMP2P08253 660 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 FGRP09769 529 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 ZCCHC18P0CG32 403 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 MATN1P21941 496 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 KLRC2P26717 231 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 CHRNA5P30532 468 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 HTR7P34969 479 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 SOX3P41225 446 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 GPR3P46089 330 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 PPOXP50336 477 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 COPAP53621 1224 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 KCNA1Q09470 495 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 ITGADQ13349 1161 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 DRP2Q13474 957 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 LY6DQ14210 128 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 TSPAN33Q86UF1 283 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 TMEM61Q8N0U2 210 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 ABHD12Q8N2K0 398 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 SLC15A4Q8N697 577 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 JMYQ8N9B5 988 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 RNF138Q8WVD3 245 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 MKL1Q969V6 931 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 TMEM18Q96B42 140 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 ARHGEF26Q96DR7 871 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 CDCA5Q96FF9 252 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 NSMCE3Q96MG7 304 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 MSTO1Q9BUK6 570 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 LHPPQ9H008 270 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 IKZF5Q9H5V7 419 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 WDCPQ9H6R7 721 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 SIX2Q9NPC8 291 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 C1RLQ9NZP8 487 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 ABCF2Q9UG63 623 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 RAB26Q9ULW5 256 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 LMTK3Q96Q04 1460 aa-0.6□□□□□ -2.5
RNU6-34P-201ENST00000364874 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-34P-201ENST00000364874 CCDC154A6NI56 674 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-34P-201ENST00000364874 SHISA9B4DS77 424 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-34P-201ENST00000364874 MYO1CO00159 1063 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-34P-201ENST00000364874 RFPL2O75678 378 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-34P-201ENST00000364874 KAT7O95251 611 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-34P-201ENST00000364874 CLDN1O95832 211 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-34P-201ENST00000364874 CLPTM1O96005 669 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-34P-201ENST00000364874 RAF1P04049 648 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-34P-201ENST00000364874 PLA2G4BP0C869 781 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-34P-201ENST00000364874 ZNF823P16415 610 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-34P-201ENST00000364874 CD34P28906 385 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-34P-201ENST00000364874 MMP14P50281 582 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-34P-201ENST00000364874 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-34P-201ENST00000364874 ITGA8P53708 1063 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-34P-201ENST00000364874 SLC37A1P57057 533 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-34P-201ENST00000364874 B3GALT5-AS1P59052 145 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-34P-201ENST00000364874 TMPRSS15P98073 1019 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-34P-201ENST00000364874 CAMK1Q14012 370 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-34P-201ENST00000364874 PTPN21Q16825 1174 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-34P-201ENST00000364874 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-34P-201ENST00000364874 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-34P-201ENST00000364874 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-34P-201ENST00000364874 EMC10Q5UCC4 262 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-34P-201ENST00000364874 RNLSQ5VYX0 342 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-34P-201ENST00000364874 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms