RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 TBATAQ96M53 351 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-227P-201ENST00000362865 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-227P-201ENST00000362865 AGXT2Q9BYV1 514 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-227P-201ENST00000362865 NUF2Q9BZD4 464 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-227P-201ENST00000362865 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-227P-201ENST00000362865 CYSLTR2Q9NS75 346 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-227P-201ENST00000362865 C20orf141Q9NUB4 165 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-227P-201ENST00000362865 WNT16Q9UBV4 365 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-227P-201ENST00000362865 PGAP2Q9UHJ9 254 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF580Q9UK33 172 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC13A4Q9UKG4 626 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-227P-201ENST00000362865 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-227P-201ENST00000362865 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-227P-201ENST00000362865 A3GALT2U3KPV4 340 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.98
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 A0A1W2PQM1 296 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCDC189A1A4V9 331 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 LINC01553A4QN01 128 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 A6NLC8 198 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 LDLRAD4O15165 306 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 NPHP1O15259 732 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 F9P00740 461 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 COX7A2P14406 83 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 ABCD3P28288 659 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 PIGAP37287 484 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 DSCR9P59020 149 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 ST3GAL1Q11201 340 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 PTP4A2Q12974 167 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 GRIK3Q13003 919 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 VEPH1Q14D04 833 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 ARHGEF6Q15052 776 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 PLCB4Q15147 1175 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM69AQ5T7M9 428 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 TXNDC8Q6A555 127 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 PDXDC1Q6P996 788 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 NOXA1Q86UR1 476 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 FJX1Q86VR8 437 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 PARP16Q8N5Y8 322 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 AADATQ8N5Z0 425 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 C11orf65Q8NCR3 313 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 IL17REQ8NFR9 667 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRIB2Q92519 343 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 ERGIC1Q969X5 290 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 MED30Q96HR3 178 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 TXNDC15Q96J42 360 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 KLHL15Q96M94 604 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 MXRA8Q9BRK3 442 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC25A33Q9BSK2 321 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 UBN1Q9NPG3 1134 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR6C3Q9NZP0 311 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 CARD8Q9Y2G2 431 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 C4orf47A7E2U8 309 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 TSPAN4O14817 238 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 KCNJ13O60928 360 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 SERPINI2O75830 405 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 VNN2O95498 520 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRSS2P07478 247 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 PCNAP12004 261 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 ATP1A3P13637 1013 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 POU1F1P28069 291 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCKBRP32239 447 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 RPL3P39023 403 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 PAFAH1B1P43034 410 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 COMPP49747 757 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 HDAC4P56524 1084 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 SGO1Q5FBB7 561 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 ACAD10Q6JQN1 1059 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 RRM2BQ7LG56 351 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM216AQ8WUB2 273 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMED6Q8WW62 240 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZUFSPQ96AP4 578 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 KIF1BPQ96EK5 621 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 BBS4Q96RK4 519 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-227P-201ENST00000362865 SIN3AQ96ST3 1273 aa2.64□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms